227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4315 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4315  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
174 aa  343  8e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169857  hitchhiker  0.00596209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3561  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  74.4 
 
 
168 aa  254  6e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4608  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  69.01 
 
 
172 aa  226  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.443527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2520  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.32 
 
 
173 aa  223  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2288  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  72.37 
 
 
180 aa  216  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000472239  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0720  RNA methyltransferase  32.37 
 
 
246 aa  62.4  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4179  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  32.09 
 
 
219 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0038  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  32.09 
 
 
230 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0042  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  32.09 
 
 
230 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0351  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  32.37 
 
 
250 aa  61.6  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3496  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  33.56 
 
 
234 aa  60.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000329165 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03508  tRNA (Guanosine-2'-O-)-methyltransferase  32.09 
 
 
229 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0054  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  32.09 
 
 
229 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0197  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  31.51 
 
 
210 aa  58.9  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0060  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  32.09 
 
 
229 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232977 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0332  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  29.55 
 
 
231 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5023  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  32.09 
 
 
229 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03460  hypothetical protein  32.09 
 
 
229 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3862  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  32.09 
 
 
229 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3501  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  30.22 
 
 
234 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4154  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  32.09 
 
 
229 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0462  RNA methyltransferase  27.01 
 
 
255 aa  58.5  0.00000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3986  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  32.09 
 
 
229 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0006  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.71 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124143  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4102  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  32.09 
 
 
229 aa  58.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0262  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  37.59 
 
 
241 aa  58.2  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.132081  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0536  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  33.58 
 
 
220 aa  58.2  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.0365793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4975  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  33.09 
 
 
235 aa  57.8  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl258  rRNA methylase  27.01 
 
 
251 aa  57  0.0000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000982584  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3881  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  29.85 
 
 
228 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0312373  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3960  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  31.58 
 
 
229 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4130  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  31.58 
 
 
229 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0146  RNA methylase  36.62 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3951  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  31.25 
 
 
230 aa  55.1  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.545722  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0418  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.29 
 
 
223 aa  55.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4148  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  31.72 
 
 
230 aa  55.5  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3469  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein  26.52 
 
 
161 aa  54.7  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.029361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4023  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  30.83 
 
 
229 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4069  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  30.83 
 
 
229 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351215  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3951  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  30.83 
 
 
229 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339816  normal  0.0254174 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82718  predicted protein  25.52 
 
 
1408 aa  54.7  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.291981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4596  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.18 
 
 
165 aa  54.7  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362437  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0929  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  29.55 
 
 
216 aa  54.7  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.29 
 
 
223 aa  54.3  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0125765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1097  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.67 
 
 
180 aa  54.3  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.734552  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4870  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  32.12 
 
 
231 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0115429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2942  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  37.5 
 
 
233 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0915  rRNA methylase  29.41 
 
 
255 aa  54.3  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00701819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1721  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.34 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1196  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.22 
 
 
246 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00157  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  29.21 
 
 
235 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1218  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.22 
 
 
246 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1756  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.71 
 
 
229 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  32.59 
 
 
251 aa  53.1  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0162  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.94 
 
 
294 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4585  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.99 
 
 
231 aa  52.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0102229  unclonable  0.0000000288798 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04781  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.5 
 
 
229 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.4365  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04421  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.29 
 
 
223 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.961343  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28928  predicted protein  32.61 
 
 
207 aa  52.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.145159  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0088  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  30.71 
 
 
229 aa  52.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0150  RNA methyltransferase  29.2 
 
 
297 aa  52  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4212  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  29.32 
 
 
230 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0414  rRNA methylase  28.89 
 
 
294 aa  52  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0145  RNA methyltransferase  29.2 
 
 
297 aa  52  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1912  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.04 
 
 
161 aa  52  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518038  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3115  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  29.32 
 
 
233 aa  52  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04831  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.83 
 
 
224 aa  51.6  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0784  RNA methyltransferase  27.37 
 
 
180 aa  51.6  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2517  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.09 
 
 
266 aa  51.2  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13158  SpoU rRNA methylase family protein  27.46 
 
 
171 aa  51.2  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.153077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0856  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.56 
 
 
296 aa  51.2  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_8000  predicted protein  42.19 
 
 
119 aa  51.2  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4495  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  30.22 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05145  putative SpoU rRNA methylase family protein  28.78 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2737  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.76 
 
 
244 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1222  RNA methyltransferase  28.37 
 
 
267 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0117794  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3539  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.73 
 
 
252 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0474859  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5165  predicted protein  29.31 
 
 
216 aa  50.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0398587 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_5166  predicted protein  29.31 
 
 
216 aa  50.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000100906  normal  0.0342071 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0766  hypothetical protein  40.85 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3388  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.68 
 
 
237 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2053  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.21 
 
 
270 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.625975  normal  0.133256 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1728  rRNA methylase  29.5 
 
 
257 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  31.34 
 
 
249 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2126  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.29 
 
 
269 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0768131  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0074  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  30.28 
 
 
228 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  30.15 
 
 
277 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1170  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.25 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000601734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1437  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  24.11 
 
 
269 aa  48.9  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0817  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  33.33 
 
 
219 aa  48.5  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1083  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.94 
 
 
263 aa  48.9  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29895  normal  0.337706 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2170  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.37 
 
 
202 aa  48.9  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1606  RNA methyltransferase  27.41 
 
 
247 aa  48.5  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0012787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1972  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30 
 
 
197 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0293079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3173  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.37 
 
 
261 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0121288  normal  0.209756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0514  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.21 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2051  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.22 
 
 
254 aa  48.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154178  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2901  tRNA/rRNA methyltransferase  31.74 
 
 
267 aa  47.8  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1853  RNA methyltransferase  26.67 
 
 
257 aa  48.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2661  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.83 
 
 
256 aa  48.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>