More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20701 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_20701  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
229 aa  474  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1577  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  74.24 
 
 
229 aa  361  7.0000000000000005e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0802  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  71.62 
 
 
229 aa  350  1e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.681579  hitchhiker  0.00885649 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04211  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.94 
 
 
229 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1756  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  63.6 
 
 
229 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04781  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  63.16 
 
 
229 aa  315  3e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.4365  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04421  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.53 
 
 
223 aa  278  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.961343  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.53 
 
 
223 aa  275  4e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0125765  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04831  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.95 
 
 
224 aa  274  7e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0418  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.14 
 
 
223 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2234  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  49.08 
 
 
216 aa  208  6e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0074  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  48.88 
 
 
228 aa  207  8e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3951  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  45 
 
 
230 aa  198  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.545722  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4495  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  42.73 
 
 
230 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03508  tRNA (Guanosine-2'-O-)-methyltransferase  46.51 
 
 
229 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3862  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.51 
 
 
229 aa  192  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0054  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.51 
 
 
229 aa  192  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5023  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.51 
 
 
229 aa  192  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4148  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  43.18 
 
 
230 aa  192  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03460  hypothetical protein  46.51 
 
 
229 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4154  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.51 
 
 
229 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4102  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.51 
 
 
229 aa  192  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0060  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.51 
 
 
229 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232977 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4212  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  42.73 
 
 
230 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3986  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.51 
 
 
229 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0088  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.48 
 
 
229 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2003  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  41.4 
 
 
224 aa  188  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3951  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  45.54 
 
 
229 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339816  normal  0.0254174 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0929  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  43.19 
 
 
216 aa  186  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3960  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  45.54 
 
 
229 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4130  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  45.54 
 
 
229 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4069  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  45.54 
 
 
229 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351215  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4023  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  45.54 
 
 
229 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0536  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  44.24 
 
 
220 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.0365793 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0262  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  45.37 
 
 
241 aa  184  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.132081  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00626  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  41.71 
 
 
227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4870  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  44.13 
 
 
231 aa  181  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0115429 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001865  tRNA (Guanosine18-2'-O-)-methyltransferase  41.23 
 
 
227 aa  181  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00157  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  44.19 
 
 
235 aa  181  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3496  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  44.24 
 
 
234 aa  181  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000329165 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0351  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  43.6 
 
 
250 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0197  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  48.28 
 
 
210 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0042  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  42.72 
 
 
230 aa  177  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0038  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  42.72 
 
 
230 aa  177  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1213  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  44.6 
 
 
216 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3501  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  40.47 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4975  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  41.86 
 
 
235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4179  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  43.14 
 
 
219 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3115  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  40.93 
 
 
233 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2942  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  40.27 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3881  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  40 
 
 
228 aa  164  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0312373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4585  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  38.53 
 
 
231 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0102229  unclonable  0.0000000288798 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0817  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  39.17 
 
 
219 aa  157  9e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0332  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  37.67 
 
 
231 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124649 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2737  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  39.35 
 
 
244 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1727  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  41.06 
 
 
212 aa  155  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1255  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  41.23 
 
 
219 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.87838  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1198  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  40.58 
 
 
224 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0312  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  42.11 
 
 
212 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2876  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  40.09 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1972  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.73 
 
 
197 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0293079 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3524  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.19 
 
 
247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0906  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  37.44 
 
 
196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000238079  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2170  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  40.72 
 
 
202 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1484  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.16 
 
 
196 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000054837  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0597  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  37.23 
 
 
250 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00512531  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11883  spoU protein (spoU)  37.97 
 
 
238 aa  118  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3141  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  40.96 
 
 
187 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.93 
 
 
239 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.282082 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3388  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.21 
 
 
237 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4310  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.24 
 
 
225 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4332  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.65 
 
 
225 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4179  tRNA/rRNA methyltransferase, SpoU  37.06 
 
 
225 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0240712  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2160  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.76 
 
 
256 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4434  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.14 
 
 
231 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18455  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1528  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32 
 
 
220 aa  100  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.16942  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2249  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.34 
 
 
234 aa  95.5  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3066  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.41 
 
 
240 aa  95.5  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5009  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.67 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2091  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.87 
 
 
247 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.254713  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1055  tyrosyl-tRNA synthetase, class Ib  38.82 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  35.1 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  32.57 
 
 
251 aa  92.4  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1903  RNA methyltransferase  39.47 
 
 
244 aa  92.4  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0247051 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1817  RNA methyltransferase  38.41 
 
 
247 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1262  RNA methyltransferase  38.41 
 
 
247 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1746  RNA methyltransferase  38.41 
 
 
247 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1971  RNA methyltransferase  38.41 
 
 
260 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2638  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.71 
 
 
259 aa  92  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1799  RNA methyltransferase  38.41 
 
 
247 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.335408  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0146  RNA methyltransferase  38.41 
 
 
247 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1020  RNA methyltransferase  38.41 
 
 
247 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0199854  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0512  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.4 
 
 
246 aa  91.7  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801962  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  39.35 
 
 
247 aa  91.7  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1469  RNA methyltransferase  38.06 
 
 
247 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2071  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.56 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0219  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.41 
 
 
274 aa  90.9  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2518  RNA methyltransferase  38.41 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00110794  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3288  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.6 
 
 
246 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679975  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1448  RNA methyltransferase  38.06 
 
 
247 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>