More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60847 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_60847  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
477 aa  970    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.858717  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44169  mitochondrial aldehyde dehydrogenase succinate semialdehyde dehydrogenase  80.29 
 
 
477 aa  795    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01541  aldehyde dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05520)  36.25 
 
 
484 aa  282  8.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.804956  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04050  cytoplasmic aldehyde dehydrogenase (Eurofung)  38.15 
 
 
482 aa  276  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310167  normal  0.390831 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  37.71 
 
 
484 aa  272  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  36.08 
 
 
481 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  38.31 
 
 
483 aa  263  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  35.55 
 
 
466 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  36.58 
 
 
466 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  34.03 
 
 
483 aa  259  9e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  35.02 
 
 
481 aa  259  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  36 
 
 
483 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  35.39 
 
 
481 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  36.17 
 
 
482 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  36.41 
 
 
482 aa  256  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  35.95 
 
 
482 aa  256  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  35.21 
 
 
498 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  36.08 
 
 
483 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  35.81 
 
 
489 aa  254  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  35.89 
 
 
483 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  36.25 
 
 
481 aa  252  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  36.24 
 
 
482 aa  249  8e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
483 aa  249  9e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  36.32 
 
 
482 aa  247  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  33.18 
 
 
483 aa  246  9e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  36.32 
 
 
482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  34.83 
 
 
482 aa  243  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  33.97 
 
 
486 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3835  aldehyde dehydrogenase  35.53 
 
 
483 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0051  aldehyde dehydrogenase  36.08 
 
 
482 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0422241  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4915  aldehyde dehydrogenase  36.08 
 
 
482 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  34.59 
 
 
488 aa  239  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0715  aldehyde dehydrogenase  36.56 
 
 
483 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210112 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0610  aldehyde dehydrogenase  35.83 
 
 
480 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3357  vanillin dehydrogenase  37.7 
 
 
482 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829356  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3211  aldehyde dehydrogenase  36.24 
 
 
483 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161018  normal  0.0254396 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4594  aldehyde dehydrogenase  35.38 
 
 
482 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140144 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5635  aldehyde dehydrogenase  35.61 
 
 
482 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.517917  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5224  aldehyde dehydrogenase  35.61 
 
 
482 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812751  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2401  aldehyde dehydrogenase  37.43 
 
 
482 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  34.74 
 
 
483 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5046  aldehyde dehydrogenase  33.65 
 
 
479 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0408609  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2501  aldehyde dehydrogenase  36.79 
 
 
483 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2630  aldehyde dehydrogenase  36.32 
 
 
483 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2582  aldehyde dehydrogenase  36.79 
 
 
483 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1971  aldehyde dehydrogenase  36.79 
 
 
483 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662558  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3481  aldehyde dehydrogenase  37.23 
 
 
484 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  32.55 
 
 
508 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  33.1 
 
 
483 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2606  aldehyde dehydrogenase  36.08 
 
 
483 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2048  aldehyde dehydrogenase  37.17 
 
 
482 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.522648  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5913  aldehyde dehydrogenase  36.08 
 
 
483 aa  226  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303901  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2827  aldehyde dehydrogenase  33.57 
 
 
483 aa  225  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.771758  normal  0.36056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1998  Aldehyde Dehydrogenase  35.35 
 
 
494 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03080  aldehyde dehydrogenase, putative  32.79 
 
 
519 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.611345  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0630  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  35.99 
 
 
482 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0836  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  35.99 
 
 
521 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2362  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  35.99 
 
 
482 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1801  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  35.99 
 
 
521 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  30.61 
 
 
480 aa  217  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1068  vanillin dehydrogenase  35.99 
 
 
521 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0706  aldehyde dehydrogenase family protein  36.01 
 
 
483 aa  216  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18514  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  31.79 
 
 
483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0347  aldehyde dehydrogenase family protein  34.84 
 
 
483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439159  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1049  aldehyde dehydrogenase family protein  34.84 
 
 
483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0646  aldehyde dehydrogenase family protein  34.84 
 
 
483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00158045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0891  putative vanillin dehydrogenase  34.84 
 
 
483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391484  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2481  aldehyde dehydrogenase family protein  34.84 
 
 
483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.695702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0888  putative vanillin dehydrogenase  34.84 
 
 
483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0094  aldehyde dehydrogenase family protein  34.84 
 
 
483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  35.59 
 
 
486 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1839  Aldehyde Dehydrogenase  34.78 
 
 
483 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.613277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.24 
 
 
477 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  31.67 
 
 
476 aa  210  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1410  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  32.28 
 
 
488 aa  206  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  31.92 
 
 
491 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2828  Aldehyde Dehydrogenase  31.92 
 
 
483 aa  205  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  31.33 
 
 
477 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4277  succinate semialdehyde dehydrogenase  31.62 
 
 
491 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  31.63 
 
 
477 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  33.86 
 
 
489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  32.51 
 
 
521 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  30.2 
 
 
483 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  33.02 
 
 
478 aa  199  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6819  aldehyde dehydrogenase  32.63 
 
 
493 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190703  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  31.79 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  33.49 
 
 
477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  29.44 
 
 
494 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  29.44 
 
 
494 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  29.44 
 
 
494 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  31.7 
 
 
478 aa  197  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  33.41 
 
 
477 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  29.44 
 
 
494 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  29.44 
 
 
494 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3490  Aldehyde Dehydrogenase  34.83 
 
 
488 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836011  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  32.58 
 
 
495 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  28.79 
 
 
483 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  30.16 
 
 
477 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  31.52 
 
 
490 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  30.41 
 
 
480 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>