136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_34797 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_34797  predicted protein  100 
 
 
422 aa  872    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.242371  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58279  predicted protein  62.86 
 
 
418 aa  555  1e-157  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36557  predicted protein  48.12 
 
 
401 aa  386  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.325381  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02390  conserved hypothetical protein  33.64 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51972  flavonol synthase  33.63 
 
 
361 aa  150  5e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.842126 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02655  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00800)  31.56 
 
 
368 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.263931 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05542  conserved hypothetical protein  29.75 
 
 
414 aa  121  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0412788  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02840  hypothetical protein  29.21 
 
 
289 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.646987  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00580  expressed protein  27.98 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0611679  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00880  conserved hypothetical protein  27 
 
 
401 aa  114  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  28.43 
 
 
318 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  28.99 
 
 
318 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  25.36 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  25.71 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10026  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11160)  27.56 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.558826  normal  0.219855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  26.39 
 
 
318 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  25.58 
 
 
320 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  25.07 
 
 
348 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  25.93 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  24.65 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  23.83 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  25.64 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  23.27 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  25.76 
 
 
327 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  27.06 
 
 
355 aa  69.3  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  21.78 
 
 
335 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  25.34 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  23.81 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  24 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  23.64 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  26.73 
 
 
316 aa  67  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31468  predicted protein  27.51 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  23.43 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  21.5 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  23.55 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  24.69 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1992  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 
281 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  24.25 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  25.35 
 
 
343 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  22.88 
 
 
355 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  22.88 
 
 
355 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  23.18 
 
 
340 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  24.62 
 
 
337 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  23.21 
 
 
328 aa  63.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  21.5 
 
 
329 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  23.38 
 
 
340 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  26.37 
 
 
338 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  25.45 
 
 
311 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  23.53 
 
 
352 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  24.21 
 
 
339 aa  61.6  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  23.72 
 
 
337 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  25 
 
 
345 aa  60.5  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  23.97 
 
 
343 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  23.97 
 
 
343 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  23.97 
 
 
343 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  21.1 
 
 
330 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  24.03 
 
 
317 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1590  2OG-Fe(II) oxygenase  26.69 
 
 
279 aa  57.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  22.15 
 
 
332 aa  57.4  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  22.92 
 
 
319 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  25.35 
 
 
316 aa  57  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  23.71 
 
 
326 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  22.14 
 
 
339 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05960  oxidoreductase, putative  23.75 
 
 
338 aa  56.2  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  22.81 
 
 
319 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  23.55 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  24.36 
 
 
311 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  21.39 
 
 
343 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  22.81 
 
 
337 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  22.77 
 
 
334 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  23.24 
 
 
309 aa  53.9  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  22.64 
 
 
352 aa  53.5  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  22.62 
 
 
348 aa  53.5  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1487  2OG-Fe(II) oxygenase  24.91 
 
 
279 aa  53.1  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1883  2OG-Fe(II) oxygenase  25.09 
 
 
279 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  21.45 
 
 
349 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  25.09 
 
 
279 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  24.38 
 
 
564 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  24.43 
 
 
330 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1856  2OG-Fe(II) oxygenase  25.09 
 
 
279 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.952041  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  25.09 
 
 
279 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0530  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  21.72 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  29.66 
 
 
279 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2637  2OG-Fe(II) oxygenase  24.74 
 
 
290 aa  52.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00402461  normal  0.0478742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  25.09 
 
 
279 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06935  conserved hypothetical protein  21.46 
 
 
213 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152982  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  21.6 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  21.6 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  30.09 
 
 
289 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  21.6 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  29.66 
 
 
279 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  30.1 
 
 
347 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2589  iron/ascorbate family oxidoreductase  24.04 
 
 
279 aa  51.2  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  24.74 
 
 
330 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2507  2OG-Fe(II) oxygenase  35.29 
 
 
279 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  24.39 
 
 
279 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  35.16 
 
 
279 aa  51.2  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  23.34 
 
 
300 aa  51.2  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  22.07 
 
 
351 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2262  2OG-Fe(II) oxygenase  24.48 
 
 
279 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>