126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_58279 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_58279  predicted protein  100 
 
 
418 aa  865    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34797  predicted protein  62.86 
 
 
422 aa  555  1e-157  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.242371  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36557  predicted protein  49.63 
 
 
401 aa  395  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.325381  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02390  conserved hypothetical protein  32.93 
 
 
367 aa  178  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51972  flavonol synthase  28.03 
 
 
361 aa  140  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.842126 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02655  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00800)  29.45 
 
 
368 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.263931 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02840  hypothetical protein  28.76 
 
 
289 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.646987  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05542  conserved hypothetical protein  29.24 
 
 
414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0412788  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00880  conserved hypothetical protein  28.78 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00580  expressed protein  27.89 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0611679  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10026  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11160)  27.34 
 
 
358 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.558826  normal  0.219855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  24.69 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  24.01 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  23.82 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  23.82 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  32.85 
 
 
330 aa  66.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  24.13 
 
 
320 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  23.23 
 
 
349 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1992  2OG-Fe(II) oxygenase  37.36 
 
 
281 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  23.41 
 
 
343 aa  63.2  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  23.51 
 
 
343 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  23.15 
 
 
337 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  22.29 
 
 
320 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  24.07 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  23.97 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  35.09 
 
 
337 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  31.78 
 
 
343 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  24.42 
 
 
318 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.29559 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  23.49 
 
 
349 aa  60.1  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  38.2 
 
 
343 aa  60.1  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  23.08 
 
 
320 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  23.03 
 
 
319 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  21.07 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  26.19 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  22.38 
 
 
326 aa  57  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  24.09 
 
 
344 aa  57.4  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  32.95 
 
 
340 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  23.77 
 
 
334 aa  56.6  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1487  2OG-Fe(II) oxygenase  32.79 
 
 
279 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  23.17 
 
 
335 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  32.76 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  31.82 
 
 
340 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  25.25 
 
 
330 aa  53.9  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  21.41 
 
 
348 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  22.37 
 
 
339 aa  53.5  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  22.4 
 
 
318 aa  53.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1590  2OG-Fe(II) oxygenase  32.17 
 
 
279 aa  53.5  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  25.79 
 
 
367 aa  53.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  24.67 
 
 
330 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  22.6 
 
 
321 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  29.41 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  30.61 
 
 
355 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  22.18 
 
 
341 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  20.39 
 
 
320 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  34.62 
 
 
347 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  24.82 
 
 
346 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  24.82 
 
 
346 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  24.82 
 
 
346 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2507  2OG-Fe(II) oxygenase  30.71 
 
 
279 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  22.08 
 
 
318 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2305  2OG-Fe(II) oxygenase  24.25 
 
 
279 aa  50.8  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.622302  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31624  predicted protein  27.87 
 
 
381 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  hitchhiker  0.00491035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  31.87 
 
 
339 aa  50.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  21.36 
 
 
352 aa  50.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  29.73 
 
 
279 aa  50.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  21.43 
 
 
332 aa  50.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  21.45 
 
 
317 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  21.94 
 
 
311 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  31.13 
 
 
279 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2185  2OG-Fe(II) oxygenase  30.97 
 
 
279 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2262  2OG-Fe(II) oxygenase  30.97 
 
 
279 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2394  2OG-Fe(II) oxygenase  30.97 
 
 
279 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1992  isopenicillin-N synthase  30.56 
 
 
279 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.254855  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  26.36 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2637  2OG-Fe(II) oxygenase  30.56 
 
 
290 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00402461  normal  0.0478742 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  20.45 
 
 
313 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  30 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  28.28 
 
 
355 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  29.21 
 
 
326 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  28.28 
 
 
355 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  30.23 
 
 
343 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  21.05 
 
 
321 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  25.24 
 
 
289 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32280  Naringenin 3-dioxygenase  27.7 
 
 
373 aa  47.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271742  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1856  2OG-Fe(II) oxygenase  30.09 
 
 
279 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.952041  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1883  2OG-Fe(II) oxygenase  29.91 
 
 
279 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  30.09 
 
 
279 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  30.09 
 
 
279 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  19.81 
 
 
340 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  30.17 
 
 
319 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  29.13 
 
 
279 aa  47.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0530  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  23.49 
 
 
330 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  22.03 
 
 
323 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  30.39 
 
 
323 aa  47  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  19.05 
 
 
335 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1982  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  26.58 
 
 
280 aa  46.6  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  27.37 
 
 
329 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  21.75 
 
 
323 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  34.25 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>