42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42968 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42968  predicted protein  100 
 
 		 609 aa  1257    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30367  predicted protein  26.27 
 
 		 597 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00270274  normal  0.0884002 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  37.63 
 
 		 674 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  33.67 
 
 		 718 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  36.56 
 
 		 674 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.56 
 
 		 680 aa  48.5  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.69 
 
 		 774 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  33.67 
 
 		 678 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  35.05 
 
 		 662 aa  47.4  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1812  DNA ligase (NAD+)  43.33 
 
 		 677 aa  47.4  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1398  putative DNA ligase (polydeoxyribonucleotide synthase [NAD+]) protein  42.62 
 
 		 813 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  40.96 
 
 		 683 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  35.11 
 
 		 688 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  35.11 
 
 		 684 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  33.01 
 
 		 711 aa  45.4  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  31.25 
 
 		 670 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  34.38 
 
 		 691 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  34.38 
 
 		 691 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  36.47 
 
 		 691 aa  45.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  35.37 
 
 		 706 aa  44.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  34.38 
 
 		 691 aa  44.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  33.7 
 
 		 673 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1371  DNA ligase, NAD-dependent  35.82 
 
 		 648 aa  44.3  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00123694  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  49.02 
 
 		 691 aa  44.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  47.06 
 
 		 688 aa  44.3  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  49.02 
 
 		 691 aa  44.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  49.02 
 
 		 691 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  29.07 
 
 		 726 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  49.02 
 
 		 691 aa  44.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  49.02 
 
 		 691 aa  44.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  49.02 
 
 		 691 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  49.02 
 
 		 691 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  42.37 
 
 		 671 aa  44.3  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  35.11 
 
 		 707 aa  44.3  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  33.01 
 
 		 673 aa  44.3  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  34.02 
 
 		 672 aa  44.3  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2505  DNA ligase, NAD-dependent  45.1 
 
 		 768 aa  43.9  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000421321 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  34.41 
 
 		 707 aa  43.9  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  34.38 
 
 		 691 aa  43.9  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0624  NAD-dependent DNA ligase  37.35 
 
 		 686 aa  43.9  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.182096  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4463  DNA ligase, NAD-dependent  36.9 
 
 		 693 aa  43.9  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0518609  normal  0.98115 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.92 
 
 		 680 aa  43.9  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>