17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30367 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_30367  predicted protein  100 
 
 
597 aa  1226    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00270274  normal  0.0884002 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42968  predicted protein  25.49 
 
 
609 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  35.71 
 
 
1001 aa  51.6  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  32.5 
 
 
1092 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  27.59 
 
 
764 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  35.63 
 
 
662 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42592  predicted protein  47.83 
 
 
62 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf373  DNA ligase  43.24 
 
 
665 aa  45.4  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000122507  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.25 
 
 
676 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  38.75 
 
 
678 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  30.3 
 
 
697 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1433  DNA ligase, NAD-dependent  32.56 
 
 
704 aa  44.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2628  NAD-dependent DNA ligase LigA  30 
 
 
693 aa  44.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.533906  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.51 
 
 
774 aa  44.3  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  48.39 
 
 
712 aa  44.3  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  32.95 
 
 
681 aa  43.9  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.73 
 
 
680 aa  43.9  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>