87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15577 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_15577  predicted protein  100 
 
 		 79 aa  161  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0227761  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  34.21 
 
 		 341 aa  58.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.71 
 
 		 706 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  35.44 
 
 		 469 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  38.75 
 
 		 363 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  38.75 
 
 		 363 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.9 
 
 		 555 aa  57  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  37.18 
 
 		 569 aa  57  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.18 
 
 		 556 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.96 
 
 		 818 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.18 
 
 		 417 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  35.23 
 
 		 418 aa  53.9  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.9 
 
 		 554 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.62 
 
 		 561 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  32.05 
 
 		 577 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  32.89 
 
 		 593 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  35.9 
 
 		 579 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.05 
 
 		 555 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  34.62 
 
 		 551 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  33.33 
 
 		 792 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  35.9 
 
 		 546 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  33.75 
 
 		 727 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  35.44 
 
 		 558 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  33.75 
 
 		 743 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  37.84 
 
 		 911 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  31.58 
 
 		 726 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  32.05 
 
 		 566 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  31.33 
 
 		 443 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  29.49 
 
 		 477 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  29.49 
 
 		 558 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  34.62 
 
 		 560 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  42.31 
 
 		 717 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  32.89 
 
 		 778 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  35.9 
 
 		 714 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  32.05 
 
 		 737 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  36.47 
 
 		 533 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.21 
 
 		 209 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.53 
 
 		 570 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  36.71 
 
 		 624 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  32.89 
 
 		 784 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  36.59 
 
 		 554 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35.37 
 
 		 1848 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  35.29 
 
 		 547 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.18 
 
 		 837 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  32.89 
 
 		 776 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.25 
 
 		 1919 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  32.43 
 
 		 461 aa  47.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  32.89 
 
 		 371 aa  47.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  35.06 
 
 		 328 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.94 
 
 		 1679 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  39.73 
 
 		 2082 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  32.91 
 
 		 1312 aa  47  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.62 
 
 		 567 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.8 
 
 		 821 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  35.06 
 
 		 399 aa  47  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  31.71 
 
 		 403 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  32.91 
 
 		 553 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  36.71 
 
 		 376 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39304  predicted protein  33.33 
 
 		 394 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635663  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.49 
 
 		 563 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  37.66 
 
 		 681 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  29.11 
 
 		 1222 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04720  pim1 protein (poly(a)+ RNA transport protein 2), putative  34.94 
 
 		 590 aa  44.3  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  35.87 
 
 		 547 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  30.77 
 
 		 807 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2561  regulator of chromosome condensation RCC1  28.38 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.91 
 
 		 817 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  34.62 
 
 		 900 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 		 692 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  29.07 
 
 		 499 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  29.49 
 
 		 618 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36476  predicted protein  27.59 
 
 		 520 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26074  predicted protein  33.33 
 
 		 783 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30 
 
 		 787 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.85 
 
 		 921 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.11 
 
 		 810 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  30.26 
 
 		 332 aa  41.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.18 
 
 		 553 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  32.89 
 
 		 643 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.63 
 
 		 941 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  28.74 
 
 		 643 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.88 
 
 		 1147 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  31.65 
 
 		 307 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  31.65 
 
 		 1187 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  27.03 
 
 		 461 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  30 
 
 		 454 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 396 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>