More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11116 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_11116  predicted protein  100 
 
 		 142 aa  288  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.778599  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  44.37 
 
 		 301 aa  110  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  43.26 
 
 		 300 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  43.26 
 
 		 300 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  42.55 
 
 		 300 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  50.43 
 
 		 300 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 312 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 		 298 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 		 307 aa  99.8  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  35.21 
 
 		 300 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  42.55 
 
 		 305 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 304 aa  97.1  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 		 312 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.32 
 
 		 287 aa  96.3  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  33.1 
 
 		 308 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  40.14 
 
 		 302 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  43.26 
 
 		 306 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.24 
 
 		 320 aa  94.4  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  42.75 
 
 		 363 aa  94  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  42.75 
 
 		 363 aa  94  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 		 324 aa  92.8  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  38.19 
 
 		 311 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  41.84 
 
 		 306 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  41.84 
 
 		 306 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  40.14 
 
 		 311 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  39.72 
 
 		 303 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.72 
 
 		 305 aa  90.9  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  44.07 
 
 		 299 aa  90.5  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  33.8 
 
 		 309 aa  90.5  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  39.72 
 
 		 300 aa  90.5  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  36.88 
 
 		 317 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  37.5 
 
 		 292 aa  89.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.73 
 
 		 312 aa  88.6  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  39.01 
 
 		 304 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.5 
 
 		 301 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.981527  normal  0.0865499 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3427  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.5 
 
 		 301 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779859  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.5 
 
 		 301 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  unclonable  0.0000194239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5768  putative short chain dehydrogenase  44.54 
 
 		 309 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 		 317 aa  87  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  42.64 
 
 		 306 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  36.17 
 
 		 316 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66520  putative short chain dehydrogenase  43.7 
 
 		 309 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.973643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 		 326 aa  86.7  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 		 298 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  34.48 
 
 		 284 aa  85.1  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  32.62 
 
 		 309 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  40.69 
 
 		 303 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.07 
 
 		 305 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  38.84 
 
 		 302 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  32.62 
 
 		 309 aa  84.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  38.3 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.3 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  32.62 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  38.3 
 
 		 333 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 288 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.3 
 
 		 328 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 315 aa  80.5  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  37.29 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 304 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 		 308 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 		 324 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 		 319 aa  78.2  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  39.53 
 
 		 329 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 		 298 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  44.07 
 
 		 305 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.01 
 
 		 301 aa  78.2  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 280 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 308 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  37.04 
 
 		 352 aa  77.4  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 		 313 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 328 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 328 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 328 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5484  predicted protein  37.06 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0315179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 		 338 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 294 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 297 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 328 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 		 310 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 303 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 		 306 aa  74.3  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  35.11 
 
 		 329 aa  73.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  41.35 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2577  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0396  carbonyl reductase  33.33 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  32.86 
 
 		 261 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 244 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  37.88 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 		 339 aa  72.4  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.08 
 
 		 238 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_4266  predicted protein  34.07 
 
 		 260 aa  72  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0181286  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 289 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 298 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 289 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>