263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_08241 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_08211  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  69.26 
 
 
720 aa  1011    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.938458  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0767  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  69.54 
 
 
720 aa  1025    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00745719  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08191  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  68.85 
 
 
720 aa  1004    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08241  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  100 
 
 
719 aa  1444    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10041  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  42.5 
 
 
720 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215358  normal  0.629602 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07951  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  43.33 
 
 
720 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0163  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.47 
 
 
720 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16721  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  39.58 
 
 
721 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1241  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.39 
 
 
720 aa  547  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.232901  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1228  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.94 
 
 
723 aa  518  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.315931 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0018  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.12 
 
 
728 aa  443  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.606807 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.52 
 
 
711 aa  446  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2337  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.52 
 
 
711 aa  446  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0794  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.99 
 
 
716 aa  439  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934108  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.57 
 
 
719 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4816  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.98 
 
 
717 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.642859 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2984  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.28 
 
 
733 aa  399  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.06 
 
 
687 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.96 
 
 
687 aa  389  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4587  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
731 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.32 
 
 
687 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.06 
 
 
694 aa  378  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1208  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.96 
 
 
693 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0414092  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.56 
 
 
690 aa  362  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.78 
 
 
698 aa  362  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.74 
 
 
687 aa  362  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.69 
 
 
688 aa  361  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.86 
 
 
686 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.8 
 
 
686 aa  355  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.96 
 
 
687 aa  355  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  30.86 
 
 
695 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  30.72 
 
 
688 aa  353  5e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.59 
 
 
690 aa  349  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.88 
 
 
692 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.32 
 
 
688 aa  340  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3935  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.58 
 
 
680 aa  336  7.999999999999999e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000397713  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1061  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.62 
 
 
691 aa  332  2e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.93 
 
 
694 aa  332  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  28.22 
 
 
696 aa  331  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.69 
 
 
691 aa  331  3e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2210  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.57 
 
 
694 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.237877 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2581  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.57 
 
 
694 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.595681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.32 
 
 
705 aa  328  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  28.41 
 
 
690 aa  324  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  30.93 
 
 
688 aa  324  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.09 
 
 
688 aa  324  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.85 
 
 
693 aa  324  4e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0335  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.78 
 
 
687 aa  323  7e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.7 
 
 
688 aa  323  7e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.48 
 
 
690 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.55 
 
 
688 aa  322  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1091  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.2 
 
 
668 aa  322  1.9999999999999998e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1319  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.08 
 
 
689 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.37 
 
 
692 aa  320  6e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1803  glycyl-tRNA synthetase beta chain  30.06 
 
 
688 aa  310  4e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.31 
 
 
690 aa  311  4e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.55 
 
 
697 aa  309  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2459  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.34 
 
 
697 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  27.88 
 
 
691 aa  306  8.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2650  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.42 
 
 
701 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1804  glycyl-tRNA synthetase beta chain  29.92 
 
 
688 aa  305  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2554  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.42 
 
 
701 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  27.45 
 
 
700 aa  304  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1195  glycine--tRNA ligase, beta subunit  28.61 
 
 
729 aa  304  5.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.22 
 
 
696 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.64 
 
 
679 aa  303  1e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1306  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.15 
 
 
701 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1197  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.86 
 
 
673 aa  301  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28917  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1246  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.47 
 
 
674 aa  300  5e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.66 
 
 
689 aa  300  6e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.37 
 
 
688 aa  300  7e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.12 
 
 
694 aa  299  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0184  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.02 
 
 
687 aa  299  1e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.58113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3868  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.2 
 
 
689 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  28.24 
 
 
693 aa  299  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.06 
 
 
689 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.37 
 
 
683 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.81 
 
 
689 aa  298  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.06 
 
 
689 aa  299  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.06 
 
 
689 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.81 
 
 
689 aa  298  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.81 
 
 
689 aa  298  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.81 
 
 
689 aa  298  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  28.81 
 
 
689 aa  298  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.06 
 
 
689 aa  298  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.81 
 
 
689 aa  298  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.81 
 
 
689 aa  298  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.81 
 
 
689 aa  297  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.81 
 
 
689 aa  297  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.24 
 
 
689 aa  296  6e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.41 
 
 
689 aa  296  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28 
 
 
697 aa  296  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1221  glycine--tRNA ligase  27.34 
 
 
696 aa  295  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.27 
 
 
696 aa  295  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.08 
 
 
692 aa  294  3e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  27.96 
 
 
683 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0994  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.17 
 
 
689 aa  294  5e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.18697  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1193  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.82 
 
 
685 aa  293  5e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.65 
 
 
684 aa  293  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1053  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.44 
 
 
678 aa  293  7e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>