33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2612 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
295 aa  600  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3366  hypothetical protein  44.96 
 
 
284 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0726961  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1389  hypothetical protein  40.14 
 
 
282 aa  217  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.918388  normal  0.184903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2868  hypothetical protein  39.51 
 
 
295 aa  208  7e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5477  hypothetical protein  41.81 
 
 
280 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.162925 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6861  hypothetical protein  38.11 
 
 
288 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12048  hypothetical protein  37.1 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0336396  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6813  hypothetical protein  38.69 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3076  hypothetical protein  32.84 
 
 
290 aa  155  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5004  hypothetical protein  38.43 
 
 
301 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.013645  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2778  hypothetical protein  33.47 
 
 
280 aa  149  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1645  hypothetical protein  34.36 
 
 
300 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1749  hypothetical protein  35.45 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0373  hypothetical protein  39.11 
 
 
187 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06810  asparagine synthetase B  44.09 
 
 
186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2858  hypothetical protein  38.2 
 
 
184 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4465  hypothetical protein  40.46 
 
 
199 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11718  hypothetical protein  30.48 
 
 
194 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4433  hypothetical protein  31.44 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0480068  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1594  hypothetical protein  35.2 
 
 
176 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4256  hypothetical protein  35.36 
 
 
184 aa  106  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181921  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0493  hypothetical protein  36.07 
 
 
195 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4199  hypothetical protein  38.35 
 
 
187 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5838  hypothetical protein  34.25 
 
 
166 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2860  hypothetical protein  34 
 
 
168 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3622  hypothetical protein  37.93 
 
 
180 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0056845  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3613  hypothetical protein  35.81 
 
 
175 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.643052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4891  hypothetical protein  37.14 
 
 
165 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1275  hypothetical protein  37.33 
 
 
171 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09141  hypothetical protein  36.21 
 
 
187 aa  85.5  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1077  hypothetical protein  38.46 
 
 
176 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.79 
 
 
564 aa  42.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3729  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  52.78 
 
 
277 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382861  normal  0.377224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>