31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2860 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2860  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  340  4e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1275  hypothetical protein  46.78 
 
 
171 aa  149  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1594  hypothetical protein  40.59 
 
 
176 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1389  hypothetical protein  49.18 
 
 
282 aa  122  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.918388  normal  0.184903 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11718  hypothetical protein  37.5 
 
 
194 aa  110  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5838  hypothetical protein  36.53 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6861  hypothetical protein  41.73 
 
 
288 aa  104  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1749  hypothetical protein  30.81 
 
 
203 aa  104  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4891  hypothetical protein  37.5 
 
 
165 aa  104  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3613  hypothetical protein  39.19 
 
 
175 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.643052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0373  hypothetical protein  37.16 
 
 
187 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5004  hypothetical protein  39.6 
 
 
301 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.013645  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6813  hypothetical protein  40.94 
 
 
287 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1077  hypothetical protein  34.32 
 
 
176 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06810  asparagine synthetase B  39.39 
 
 
186 aa  100  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3622  hypothetical protein  35.09 
 
 
180 aa  97.4  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0056845  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  34 
 
 
295 aa  96.3  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3076  hypothetical protein  32.9 
 
 
290 aa  96.3  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1645  hypothetical protein  38.31 
 
 
300 aa  95.5  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4199  hypothetical protein  35.07 
 
 
187 aa  95.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4465  hypothetical protein  43.4 
 
 
199 aa  95.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4256  hypothetical protein  37.96 
 
 
184 aa  92.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181921  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2858  hypothetical protein  35.33 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0493  hypothetical protein  33.69 
 
 
195 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3366  hypothetical protein  38.24 
 
 
284 aa  86.3  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0726961  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5477  hypothetical protein  32.12 
 
 
280 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.162925 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2868  hypothetical protein  33.94 
 
 
295 aa  86.3  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09141  hypothetical protein  46.34 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12048  hypothetical protein  30.11 
 
 
281 aa  78.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0336396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2778  hypothetical protein  35.83 
 
 
280 aa  78.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4433  hypothetical protein  30.57 
 
 
388 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0480068  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>