31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1389 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1389  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.918388  normal  0.184903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2868  hypothetical protein  50 
 
 
295 aa  270  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3366  hypothetical protein  46.29 
 
 
284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0726961  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5477  hypothetical protein  46.79 
 
 
280 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.162925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  41.2 
 
 
295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6861  hypothetical protein  37.28 
 
 
288 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6813  hypothetical protein  37.28 
 
 
287 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2778  hypothetical protein  35.04 
 
 
280 aa  162  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1645  hypothetical protein  36.5 
 
 
300 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12048  hypothetical protein  34.17 
 
 
281 aa  152  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0336396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3076  hypothetical protein  32.73 
 
 
290 aa  152  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1749  hypothetical protein  41.57 
 
 
203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5004  hypothetical protein  36.26 
 
 
301 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.013645  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1594  hypothetical protein  38.42 
 
 
176 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2858  hypothetical protein  38.64 
 
 
184 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06810  asparagine synthetase B  46.46 
 
 
186 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195915  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4465  hypothetical protein  44.27 
 
 
199 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2860  hypothetical protein  49.18 
 
 
168 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5838  hypothetical protein  41.71 
 
 
166 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4256  hypothetical protein  41.79 
 
 
184 aa  115  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181921  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0493  hypothetical protein  44.09 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1275  hypothetical protein  40 
 
 
171 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4199  hypothetical protein  41.35 
 
 
187 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3613  hypothetical protein  38.95 
 
 
175 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.643052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0373  hypothetical protein  42.19 
 
 
187 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1077  hypothetical protein  42.03 
 
 
176 aa  105  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11718  hypothetical protein  38.57 
 
 
194 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3622  hypothetical protein  38.41 
 
 
180 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0056845  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4891  hypothetical protein  34.06 
 
 
165 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09141  hypothetical protein  34.42 
 
 
187 aa  86.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4433  hypothetical protein  30.66 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0480068  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>