31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1749 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1749  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  414  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1389  hypothetical protein  41.57 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.918388  normal  0.184903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5477  hypothetical protein  36.41 
 
 
280 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.162925 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5838  hypothetical protein  42.05 
 
 
166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3076  hypothetical protein  37.37 
 
 
290 aa  132  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 
295 aa  132  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2858  hypothetical protein  35.71 
 
 
184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4199  hypothetical protein  43.61 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109312  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2868  hypothetical protein  38.15 
 
 
295 aa  122  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6813  hypothetical protein  32.95 
 
 
287 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3366  hypothetical protein  38.54 
 
 
284 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0726961  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4256  hypothetical protein  35.87 
 
 
184 aa  119  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181921  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6861  hypothetical protein  31.21 
 
 
288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0373  hypothetical protein  36.55 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0493  hypothetical protein  36.07 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4465  hypothetical protein  34.03 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12048  hypothetical protein  33.87 
 
 
281 aa  115  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0336396  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06810  asparagine synthetase B  35.87 
 
 
186 aa  115  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3622  hypothetical protein  36.52 
 
 
180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0056845  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1077  hypothetical protein  38.33 
 
 
176 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1594  hypothetical protein  32.34 
 
 
176 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5004  hypothetical protein  33.52 
 
 
301 aa  106  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.013645  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2778  hypothetical protein  34.55 
 
 
280 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4891  hypothetical protein  38.85 
 
 
165 aa  105  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2860  hypothetical protein  30.81 
 
 
168 aa  104  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3613  hypothetical protein  32.39 
 
 
175 aa  99.4  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.643052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11718  hypothetical protein  26.94 
 
 
194 aa  97.1  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1645  hypothetical protein  28.41 
 
 
300 aa  89.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1275  hypothetical protein  31.29 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4433  hypothetical protein  30.57 
 
 
388 aa  78.2  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0480068  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09141  hypothetical protein  30.67 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>