31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3366 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3366  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  572  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0726961  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2868  hypothetical protein  64.29 
 
 
295 aa  368  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5477  hypothetical protein  54.26 
 
 
280 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.162925 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1389  hypothetical protein  46.29 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.918388  normal  0.184903 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  45.87 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6861  hypothetical protein  39.3 
 
 
288 aa  191  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12048  hypothetical protein  41.04 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0336396  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6813  hypothetical protein  40.15 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2778  hypothetical protein  37.59 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3076  hypothetical protein  32.37 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1645  hypothetical protein  35.4 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5004  hypothetical protein  38.75 
 
 
301 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.013645  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1749  hypothetical protein  38.54 
 
 
203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06810  asparagine synthetase B  40.22 
 
 
186 aa  112  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195915  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1594  hypothetical protein  35.33 
 
 
176 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5838  hypothetical protein  40.94 
 
 
166 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4256  hypothetical protein  41.04 
 
 
184 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181921  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1077  hypothetical protein  39.41 
 
 
176 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4199  hypothetical protein  41.86 
 
 
187 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4465  hypothetical protein  39.85 
 
 
199 aa  99.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1275  hypothetical protein  34.32 
 
 
171 aa  99.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3622  hypothetical protein  41.13 
 
 
180 aa  99.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0056845  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2858  hypothetical protein  38.81 
 
 
184 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11718  hypothetical protein  33.08 
 
 
194 aa  94.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4433  hypothetical protein  30.54 
 
 
388 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0480068  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09141  hypothetical protein  31.89 
 
 
187 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0373  hypothetical protein  34.81 
 
 
187 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4891  hypothetical protein  37.41 
 
 
165 aa  89.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2860  hypothetical protein  38.24 
 
 
168 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3613  hypothetical protein  32.59 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.643052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0493  hypothetical protein  33.59 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>