31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12048 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12048  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  576  1.0000000000000001e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0336396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2778  hypothetical protein  45.68 
 
 
280 aa  249  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2868  hypothetical protein  43.97 
 
 
295 aa  210  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3366  hypothetical protein  41.04 
 
 
284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0726961  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  38.87 
 
 
295 aa  185  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5477  hypothetical protein  37.99 
 
 
280 aa  178  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.162925 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6861  hypothetical protein  37.22 
 
 
288 aa  175  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6813  hypothetical protein  37.01 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1389  hypothetical protein  34.17 
 
 
282 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.918388  normal  0.184903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1645  hypothetical protein  36.54 
 
 
300 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3076  hypothetical protein  33.33 
 
 
290 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5004  hypothetical protein  36.13 
 
 
301 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.013645  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06810  asparagine synthetase B  45.38 
 
 
186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195915  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1749  hypothetical protein  33.87 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1594  hypothetical protein  33.53 
 
 
176 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5838  hypothetical protein  35.96 
 
 
166 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4465  hypothetical protein  37.69 
 
 
199 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2858  hypothetical protein  37.88 
 
 
184 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3622  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  99  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0056845  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4199  hypothetical protein  35.1 
 
 
187 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109312  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09141  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  93.6  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3613  hypothetical protein  30.34 
 
 
175 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.643052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0373  hypothetical protein  33.7 
 
 
187 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4256  hypothetical protein  33.87 
 
 
184 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181921  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1077  hypothetical protein  34.62 
 
 
176 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0493  hypothetical protein  34.27 
 
 
195 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4891  hypothetical protein  34.04 
 
 
165 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2860  hypothetical protein  30.11 
 
 
168 aa  79  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4433  hypothetical protein  28.28 
 
 
388 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0480068  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1275  hypothetical protein  30.56 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11718  hypothetical protein  28.29 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>