31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5838 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5838  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1077  hypothetical protein  54.07 
 
 		 176 aa  184  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4891  hypothetical protein  56.55 
 
 		 165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06810  asparagine synthetase B  39.46 
 
 		 186 aa  135  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195915  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1749  hypothetical protein  42.05 
 
 		 203 aa  133  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1594  hypothetical protein  44.77 
 
 		 176 aa  130  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2858  hypothetical protein  48.23 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4199  hypothetical protein  41.36 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4465  hypothetical protein  45.11 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4256  hypothetical protein  40.22 
 
 		 184 aa  121  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1389  hypothetical protein  41.71 
 
 		 282 aa  119  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.918388  normal  0.184903 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3622  hypothetical protein  41.24 
 
 		 180 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0056845  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0373  hypothetical protein  45.38 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3613  hypothetical protein  36.93 
 
 		 175 aa  114  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3076  hypothetical protein  37.57 
 
 		 290 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0493  hypothetical protein  37.84 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2860  hypothetical protein  36.53 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2868  hypothetical protein  37.78 
 
 		 295 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3366  hypothetical protein  40.94 
 
 		 284 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0726961  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6861  hypothetical protein  38.95 
 
 		 288 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12048  hypothetical protein  35.96 
 
 		 281 aa  104  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0336396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5477  hypothetical protein  41.01 
 
 		 280 aa  101  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.162925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 		 295 aa  101  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1275  hypothetical protein  37.93 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6813  hypothetical protein  38.24 
 
 		 287 aa  96.3  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2778  hypothetical protein  33.15 
 
 		 280 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09141  hypothetical protein  33.55 
 
 		 187 aa  87.8  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5004  hypothetical protein  39.68 
 
 		 301 aa  82  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.013645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11718  hypothetical protein  31.58 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1645  hypothetical protein  32.93 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4433  hypothetical protein  40 
 
 		 388 aa  62  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0480068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>