31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0493 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0493  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4256  hypothetical protein  48.9 
 
 		 184 aa  177  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4199  hypothetical protein  48.09 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2858  hypothetical protein  47.03 
 
 		 184 aa  164  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4465  hypothetical protein  48.13 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06810  asparagine synthetase B  40.53 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195915  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1594  hypothetical protein  46.88 
 
 		 176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0373  hypothetical protein  42.64 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1749  hypothetical protein  36.07 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1389  hypothetical protein  44.09 
 
 		 282 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.918388  normal  0.184903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5838  hypothetical protein  37.84 
 
 		 166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3613  hypothetical protein  39.42 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1077  hypothetical protein  38.24 
 
 		 176 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3622  hypothetical protein  38.81 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0056845  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  36.69 
 
 		 295 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3076  hypothetical protein  31.89 
 
 		 290 aa  98.2  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4891  hypothetical protein  38.81 
 
 		 165 aa  95.5  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6861  hypothetical protein  40.16 
 
 		 288 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6813  hypothetical protein  37.86 
 
 		 287 aa  92.8  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5477  hypothetical protein  37.69 
 
 		 280 aa  92  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.162925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2860  hypothetical protein  33.69 
 
 		 168 aa  88.6  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12048  hypothetical protein  34.27 
 
 		 281 aa  86.7  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0336396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2778  hypothetical protein  38.13 
 
 		 280 aa  85.9  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09141  hypothetical protein  34.51 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1275  hypothetical protein  37.5 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5004  hypothetical protein  35.51 
 
 		 301 aa  78.2  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.013645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3366  hypothetical protein  33.59 
 
 		 284 aa  77.8  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0726961  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2868  hypothetical protein  29.95 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1645  hypothetical protein  30.61 
 
 		 300 aa  67.8  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11718  hypothetical protein  27.94 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4433  hypothetical protein  33.98 
 
 		 388 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0480068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>