31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4256 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4256  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  375  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181921  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4199  hypothetical protein  54.01 
 
 
187 aa  208  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0493  hypothetical protein  48.9 
 
 
195 aa  177  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2858  hypothetical protein  47.8 
 
 
184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4465  hypothetical protein  40.84 
 
 
199 aa  152  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06810  asparagine synthetase B  38.1 
 
 
186 aa  152  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195915  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0373  hypothetical protein  40.54 
 
 
187 aa  136  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3622  hypothetical protein  38.04 
 
 
180 aa  121  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0056845  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5838  hypothetical protein  40.22 
 
 
166 aa  121  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1077  hypothetical protein  40.88 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1749  hypothetical protein  35.87 
 
 
203 aa  119  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1389  hypothetical protein  41.79 
 
 
282 aa  115  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.918388  normal  0.184903 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3076  hypothetical protein  33.85 
 
 
290 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3613  hypothetical protein  35.16 
 
 
175 aa  108  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.643052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5477  hypothetical protein  39.13 
 
 
280 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.162925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
295 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3366  hypothetical protein  41.04 
 
 
284 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0726961  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4891  hypothetical protein  39.42 
 
 
165 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1594  hypothetical protein  35.14 
 
 
176 aa  97.8  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2860  hypothetical protein  37.96 
 
 
168 aa  92.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6813  hypothetical protein  37.58 
 
 
287 aa  92  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2778  hypothetical protein  37.31 
 
 
280 aa  91.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6861  hypothetical protein  36.3 
 
 
288 aa  89.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12048  hypothetical protein  33.87 
 
 
281 aa  87.8  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0336396  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09141  hypothetical protein  29.89 
 
 
187 aa  87.4  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2868  hypothetical protein  37.12 
 
 
295 aa  87  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11718  hypothetical protein  34.07 
 
 
194 aa  85.1  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5004  hypothetical protein  35.82 
 
 
301 aa  84.3  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.013645  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1645  hypothetical protein  36.88 
 
 
300 aa  81.3  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1275  hypothetical protein  35.92 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4433  hypothetical protein  36.36 
 
 
388 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0480068  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>