31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3622 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3622  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  368  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0056845  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3613  hypothetical protein  46.37 
 
 		 175 aa  174  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0373  hypothetical protein  45.27 
 
 		 187 aa  124  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1077  hypothetical protein  42.67 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4256  hypothetical protein  38.04 
 
 		 184 aa  121  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06810  asparagine synthetase B  40.3 
 
 		 186 aa  120  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4891  hypothetical protein  42.96 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09141  hypothetical protein  34.59 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5838  hypothetical protein  41.24 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2858  hypothetical protein  36.56 
 
 		 184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1749  hypothetical protein  36.52 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4465  hypothetical protein  34.69 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4199  hypothetical protein  40.44 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109312  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1594  hypothetical protein  33.53 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0493  hypothetical protein  38.81 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2778  hypothetical protein  32.24 
 
 		 280 aa  99.8  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3076  hypothetical protein  32.22 
 
 		 290 aa  99.4  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3366  hypothetical protein  41.13 
 
 		 284 aa  99.4  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0726961  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12048  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  99  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0336396  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2860  hypothetical protein  35.09 
 
 		 168 aa  97.4  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5004  hypothetical protein  35 
 
 		 301 aa  95.5  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.013645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5477  hypothetical protein  39.42 
 
 		 280 aa  95.5  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.162925 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1389  hypothetical protein  38.41 
 
 		 282 aa  94.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.918388  normal  0.184903 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  38.19 
 
 		 295 aa  94  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6813  hypothetical protein  35.76 
 
 		 287 aa  93.2  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6861  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  92.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1275  hypothetical protein  38.51 
 
 		 171 aa  91.7  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2868  hypothetical protein  36.69 
 
 		 295 aa  87.8  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1645  hypothetical protein  29.31 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11718  hypothetical protein  26.77 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4433  hypothetical protein  33.96 
 
 		 388 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0480068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>