31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4433 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4433  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  804    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0480068  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
295 aa  106  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2868  hypothetical protein  31.6 
 
 
295 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2778  hypothetical protein  30.74 
 
 
280 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3366  hypothetical protein  30.54 
 
 
284 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0726961  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1389  hypothetical protein  30.66 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.918388  normal  0.184903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1645  hypothetical protein  26.76 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1749  hypothetical protein  30.57 
 
 
203 aa  78.2  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6861  hypothetical protein  28.94 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6813  hypothetical protein  32.27 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1275  hypothetical protein  35.03 
 
 
171 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0373  hypothetical protein  32.34 
 
 
187 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4465  hypothetical protein  35.53 
 
 
199 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12048  hypothetical protein  29.84 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0336396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5477  hypothetical protein  30.58 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.162925 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11718  hypothetical protein  28.37 
 
 
194 aa  71.2  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5004  hypothetical protein  26.53 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.013645  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2858  hypothetical protein  40.65 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1594  hypothetical protein  29.84 
 
 
176 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4256  hypothetical protein  36.36 
 
 
184 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181921  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3076  hypothetical protein  29.74 
 
 
290 aa  63.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2860  hypothetical protein  30.57 
 
 
168 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3613  hypothetical protein  34.48 
 
 
175 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.643052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06810  asparagine synthetase B  35.24 
 
 
186 aa  62.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5838  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4199  hypothetical protein  32.86 
 
 
187 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4891  hypothetical protein  37.5 
 
 
165 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3622  hypothetical protein  33.96 
 
 
180 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0056845  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1077  hypothetical protein  39.02 
 
 
176 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0493  hypothetical protein  33.98 
 
 
195 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09141  hypothetical protein  35.63 
 
 
187 aa  47.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>