32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5004 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5004  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  605  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.013645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1645  hypothetical protein  41.45 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6861  hypothetical protein  40 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6813  hypothetical protein  39.08 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  38.59 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3366  hypothetical protein  38.75 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0726961  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5477  hypothetical protein  39.92 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.162925 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1389  hypothetical protein  36.26 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.918388  normal  0.184903 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12048  hypothetical protein  35.4 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0336396  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2868  hypothetical protein  36.33 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3076  hypothetical protein  29.27 
 
 		 290 aa  125  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11718  hypothetical protein  36.67 
 
 		 194 aa  122  8e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2778  hypothetical protein  34.33 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06810  asparagine synthetase B  45.45 
 
 		 186 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195915  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1749  hypothetical protein  33.52 
 
 		 203 aa  106  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1275  hypothetical protein  37.71 
 
 		 171 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2860  hypothetical protein  39.6 
 
 		 168 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0373  hypothetical protein  32.81 
 
 		 187 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2858  hypothetical protein  40.6 
 
 		 184 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4465  hypothetical protein  40.15 
 
 		 199 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1594  hypothetical protein  35.54 
 
 		 176 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3622  hypothetical protein  35 
 
 		 180 aa  95.5  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0056845  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3613  hypothetical protein  31.64 
 
 		 175 aa  93.2  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4199  hypothetical protein  38.81 
 
 		 187 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1077  hypothetical protein  38.46 
 
 		 176 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4891  hypothetical protein  38.85 
 
 		 165 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4256  hypothetical protein  35.82 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5838  hypothetical protein  39.68 
 
 		 166 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09141  hypothetical protein  28.39 
 
 		 187 aa  79  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0493  hypothetical protein  35.51 
 
 		 195 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4433  hypothetical protein  26.53 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0480068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1642  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 352 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0305016  normal  0.0251557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>