31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6813 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013731  Slin_6813  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  583  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6861  hypothetical protein  84.27 
 
 
288 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3076  hypothetical protein  39.93 
 
 
290 aa  209  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2868  hypothetical protein  41.18 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5477  hypothetical protein  41.2 
 
 
280 aa  195  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.162925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3366  hypothetical protein  40.15 
 
 
284 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0726961  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 
295 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1389  hypothetical protein  39.31 
 
 
282 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.918388  normal  0.184903 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12048  hypothetical protein  37.01 
 
 
281 aa  167  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0336396  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5004  hypothetical protein  38.43 
 
 
301 aa  165  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.013645  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1645  hypothetical protein  37.3 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2778  hypothetical protein  38.06 
 
 
280 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1594  hypothetical protein  39.43 
 
 
176 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1749  hypothetical protein  32.95 
 
 
203 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0373  hypothetical protein  42.11 
 
 
187 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06810  asparagine synthetase B  46.51 
 
 
186 aa  116  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195915  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11718  hypothetical protein  37.93 
 
 
194 aa  113  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1275  hypothetical protein  41.1 
 
 
171 aa  112  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4465  hypothetical protein  40.71 
 
 
199 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2860  hypothetical protein  40.94 
 
 
168 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4199  hypothetical protein  38.93 
 
 
187 aa  102  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2858  hypothetical protein  39.69 
 
 
184 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09141  hypothetical protein  37.91 
 
 
187 aa  99  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5838  hypothetical protein  38.24 
 
 
166 aa  96.3  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3613  hypothetical protein  38.17 
 
 
175 aa  93.2  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.643052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3622  hypothetical protein  35.76 
 
 
180 aa  93.6  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0056845  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0493  hypothetical protein  37.86 
 
 
195 aa  92.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4256  hypothetical protein  37.58 
 
 
184 aa  92  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181921  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1077  hypothetical protein  32.39 
 
 
176 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4891  hypothetical protein  38.98 
 
 
165 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4433  hypothetical protein  30 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0480068  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>