31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5477 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5477  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.162925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3366  hypothetical protein  54.26 
 
 		 284 aa  293  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0726961  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2868  hypothetical protein  53.14 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1389  hypothetical protein  46.79 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.918388  normal  0.184903 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  42.59 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6813  hypothetical protein  41.2 
 
 		 287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6861  hypothetical protein  39.7 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12048  hypothetical protein  37.99 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0336396  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1645  hypothetical protein  37.81 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3076  hypothetical protein  35.51 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2778  hypothetical protein  36.8 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5004  hypothetical protein  39.85 
 
 		 301 aa  145  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.013645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1749  hypothetical protein  36.41 
 
 		 203 aa  135  7.000000000000001e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06810  asparagine synthetase B  44.7 
 
 		 186 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2858  hypothetical protein  40.14 
 
 		 184 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4465  hypothetical protein  41.35 
 
 		 199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1594  hypothetical protein  39.43 
 
 		 176 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4199  hypothetical protein  43.18 
 
 		 187 aa  109  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4256  hypothetical protein  39.13 
 
 		 184 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0373  hypothetical protein  36.71 
 
 		 187 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5838  hypothetical protein  41.01 
 
 		 166 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1275  hypothetical protein  36.09 
 
 		 171 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3622  hypothetical protein  39.42 
 
 		 180 aa  95.9  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0056845  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11718  hypothetical protein  31.58 
 
 		 194 aa  94.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0493  hypothetical protein  37.69 
 
 		 195 aa  92  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1077  hypothetical protein  38.6 
 
 		 176 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3613  hypothetical protein  30.68 
 
 		 175 aa  85.9  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2860  hypothetical protein  32.12 
 
 		 168 aa  85.9  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09141  hypothetical protein  33.76 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4891  hypothetical protein  37.14 
 
 		 165 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4433  hypothetical protein  28.57 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0480068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>