31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06810 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_06810  asparagine synthetase B  100 
 
 
186 aa  384  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195915  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4199  hypothetical protein  41.58 
 
 
187 aa  168  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4465  hypothetical protein  42.56 
 
 
199 aa  165  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2858  hypothetical protein  42.33 
 
 
184 aa  162  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4256  hypothetical protein  38.1 
 
 
184 aa  152  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181921  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0493  hypothetical protein  40.53 
 
 
195 aa  152  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0373  hypothetical protein  40.22 
 
 
187 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5838  hypothetical protein  39.46 
 
 
166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1077  hypothetical protein  43.23 
 
 
176 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1389  hypothetical protein  46.46 
 
 
282 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.918388  normal  0.184903 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3622  hypothetical protein  40.3 
 
 
180 aa  120  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0056845  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  44.09 
 
 
295 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5477  hypothetical protein  44.7 
 
 
280 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.162925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1594  hypothetical protein  36.93 
 
 
176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3076  hypothetical protein  33.69 
 
 
290 aa  118  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12048  hypothetical protein  45.38 
 
 
281 aa  117  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0336396  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6813  hypothetical protein  46.51 
 
 
287 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2778  hypothetical protein  35.14 
 
 
280 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1749  hypothetical protein  35.87 
 
 
203 aa  115  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6861  hypothetical protein  45.04 
 
 
288 aa  114  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3613  hypothetical protein  31.18 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.643052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3366  hypothetical protein  40.22 
 
 
284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0726961  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4891  hypothetical protein  43.28 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5004  hypothetical protein  45.45 
 
 
301 aa  107  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.013645  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09141  hypothetical protein  35.9 
 
 
187 aa  106  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2860  hypothetical protein  39.39 
 
 
168 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2868  hypothetical protein  42.64 
 
 
295 aa  99  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1645  hypothetical protein  39.84 
 
 
300 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11718  hypothetical protein  36.15 
 
 
194 aa  92.4  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1275  hypothetical protein  35.79 
 
 
171 aa  91.3  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4433  hypothetical protein  35.24 
 
 
388 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0480068  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>