31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3613 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3613  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  358  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3622  hypothetical protein  46.37 
 
 		 180 aa  174  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0056845  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1594  hypothetical protein  36.9 
 
 		 176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09141  hypothetical protein  37.43 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0373  hypothetical protein  42.38 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5838  hypothetical protein  36.93 
 
 		 166 aa  114  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4465  hypothetical protein  38.73 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06810  asparagine synthetase B  31.18 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195915  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1389  hypothetical protein  38.95 
 
 		 282 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.918388  normal  0.184903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0493  hypothetical protein  39.42 
 
 		 195 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4256  hypothetical protein  35.16 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2860  hypothetical protein  39.19 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3076  hypothetical protein  31.28 
 
 		 290 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4199  hypothetical protein  37.69 
 
 		 187 aa  101  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109312  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6861  hypothetical protein  37.93 
 
 		 288 aa  101  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1749  hypothetical protein  32.39 
 
 		 203 aa  99.4  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2868  hypothetical protein  34.27 
 
 		 295 aa  97.4  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2778  hypothetical protein  35.53 
 
 		 280 aa  96.7  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1275  hypothetical protein  35.33 
 
 		 171 aa  94.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2858  hypothetical protein  34.01 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5004  hypothetical protein  31.64 
 
 		 301 aa  93.2  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.013645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6813  hypothetical protein  38.17 
 
 		 287 aa  93.2  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12048  hypothetical protein  30.34 
 
 		 281 aa  91.3  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0336396  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4891  hypothetical protein  30.38 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 295 aa  89  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1077  hypothetical protein  36.43 
 
 		 176 aa  88.6  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5477  hypothetical protein  30.68 
 
 		 280 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.162925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1645  hypothetical protein  37.04 
 
 		 300 aa  85.5  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11718  hypothetical protein  29.1 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3366  hypothetical protein  32.59 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0726961  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4433  hypothetical protein  34.48 
 
 		 388 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0480068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>