31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1645 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1645  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  612  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5004  hypothetical protein  41.45 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.013645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3366  hypothetical protein  35.4 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0726961  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6861  hypothetical protein  36.47 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5477  hypothetical protein  39.92 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.162925 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6813  hypothetical protein  37.82 
 
 		 287 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1389  hypothetical protein  36.5 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.918388  normal  0.184903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2868  hypothetical protein  35.42 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3076  hypothetical protein  33.21 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12048  hypothetical protein  35.77 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0336396  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2612  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2778  hypothetical protein  36.44 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1594  hypothetical protein  37.36 
 
 		 176 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1275  hypothetical protein  40.96 
 
 		 171 aa  109  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2860  hypothetical protein  38.31 
 
 		 168 aa  95.5  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06810  asparagine synthetase B  39.84 
 
 		 186 aa  94  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195915  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09141  hypothetical protein  30.34 
 
 		 187 aa  90.5  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0373  hypothetical protein  34.86 
 
 		 187 aa  89.4  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1749  hypothetical protein  28.41 
 
 		 203 aa  89.4  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3613  hypothetical protein  37.04 
 
 		 175 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4465  hypothetical protein  42.2 
 
 		 199 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4199  hypothetical protein  39.45 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109312  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11718  hypothetical protein  32.12 
 
 		 194 aa  81.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3622  hypothetical protein  29.31 
 
 		 180 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0056845  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4256  hypothetical protein  36.88 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2858  hypothetical protein  37.4 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4433  hypothetical protein  26.76 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0480068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4891  hypothetical protein  38.35 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5838  hypothetical protein  32.93 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0493  hypothetical protein  30.61 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1077  hypothetical protein  43.42 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.354079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>