36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0528 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0528  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  179  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3273  hypothetical protein  73.33 
 
 		 776 aa  90.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  70 
 
 		 796 aa  87.8  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  70 
 
 		 793 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1134  EcoEI R domain-containing protein  70 
 
 		 780 aa  87  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0352  EcoEI R domain-containing protein  71.67 
 
 		 791 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4614  EcoEI R domain-containing protein  56.52 
 
 		 790 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000837819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  61.67 
 
 		 788 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4740  type I restriction-modification system, R subunit  56.92 
 
 		 787 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  63.33 
 
 		 811 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3535  hypothetical protein  64.29 
 
 		 815 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.115476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  64.29 
 
 		 815 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  56.45 
 
 		 800 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02070  type I restriction enzyme EcoAI R protein  52.17 
 
 		 793 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  61.67 
 
 		 813 aa  72  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0683  type I restriction-modification system, R subunit  51.52 
 
 		 784 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0832  EcoEI R domain protein  51.52 
 
 		 784 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.916446  normal  0.633032 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  53.03 
 
 		 783 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2006  hypothetical protein  53.33 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00119735  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  55 
 
 		 829 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  53.33 
 
 		 825 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  53.33 
 
 		 824 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  48.21 
 
 		 770 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  49.21 
 
 		 824 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  46.77 
 
 		 821 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  49.18 
 
 		 817 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  48.33 
 
 		 765 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  49.18 
 
 		 827 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0005  putative type I restriction enzyme, R subunit  46.03 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  45.31 
 
 		 809 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  46.67 
 
 		 810 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1414  hypothetical protein  45.1 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.365859  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  41.67 
 
 		 791 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  39.29 
 
 		 796 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  40.35 
 
 		 761 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1018  type III restriction enzyme, res subunit  41.07 
 
 		 769 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>