40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0005 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0005  putative type I restriction enzyme, R subunit  100 
 
 		 119 aa  243  9e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  63.51 
 
 		 817 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  63.51 
 
 		 827 aa  100  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  60.27 
 
 		 824 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  51.35 
 
 		 793 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3273  hypothetical protein  54.05 
 
 		 776 aa  84.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  48.65 
 
 		 796 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  56.16 
 
 		 783 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0352  EcoEI R domain-containing protein  47.3 
 
 		 791 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  50 
 
 		 788 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1018  type III restriction enzyme, res subunit  52.86 
 
 		 769 aa  79.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0832  EcoEI R domain protein  53.42 
 
 		 784 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.916446  normal  0.633032 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0683  type I restriction-modification system, R subunit  53.42 
 
 		 784 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1134  EcoEI R domain-containing protein  50 
 
 		 780 aa  77.4  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4614  EcoEI R domain-containing protein  47.3 
 
 		 790 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000837819 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  51.47 
 
 		 770 aa  74.7  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4740  type I restriction-modification system, R subunit  44.59 
 
 		 787 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141278 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2006  hypothetical protein  45.95 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00119735  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  45.95 
 
 		 825 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  47.3 
 
 		 829 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02070  type I restriction enzyme EcoAI R protein  47.3 
 
 		 793 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  45.83 
 
 		 800 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3535  hypothetical protein  48.65 
 
 		 815 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.115476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  43.24 
 
 		 811 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  45.95 
 
 		 824 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  48.65 
 
 		 815 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  45.95 
 
 		 810 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  48.65 
 
 		 821 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  48.53 
 
 		 809 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  47.06 
 
 		 761 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  41.89 
 
 		 813 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  40.54 
 
 		 765 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0528  hypothetical protein  46.03 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1311  restriction modification system DNA specificity subunit  71.43 
 
 		 578 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1015  restriction modification system DNA specificity subunit  65.79 
 
 		 575 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  46.67 
 
 		 780 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  37.68 
 
 		 791 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  40.54 
 
 		 899 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1414  hypothetical protein  40.82 
 
 		 103 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.365859  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  31.88 
 
 		 796 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>