More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_40730 on replicon NC_009369
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009369  OSTLU_40730  predicted protein  100 
 
 
623 aa  1296    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0282843  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45510  long chain acyl-coa synthetase  46.23 
 
 
663 aa  531  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 
596 aa  345  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 
607 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 
616 aa  310  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  34.28 
 
 
597 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 
618 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 
626 aa  273  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 
613 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 
604 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 
604 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 
604 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5953  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 
612 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664785  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 
605 aa  263  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 
609 aa  263  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.58 
 
 
597 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 
599 aa  262  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 
623 aa  262  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.73 
 
 
602 aa  262  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 
599 aa  261  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 
600 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 
604 aa  259  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 
593 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.96 
 
 
599 aa  256  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30 
 
 
598 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4370  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 
601 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  32.15 
 
 
607 aa  255  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 
605 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 
606 aa  249  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3837  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 
601 aa  249  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 
610 aa  248  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 
622 aa  247  4.9999999999999997e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 
603 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 
595 aa  245  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 
603 aa  244  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 
601 aa  244  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.76 
 
 
606 aa  243  9e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 
615 aa  242  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 
633 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 
596 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  28.1 
 
 
604 aa  241  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 
607 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  28.43 
 
 
611 aa  241  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  29.24 
 
 
603 aa  241  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 
602 aa  240  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  30.22 
 
 
616 aa  239  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  28.64 
 
 
617 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 
610 aa  238  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 
607 aa  237  6e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.89 
 
 
611 aa  237  6e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 
603 aa  236  7e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 
602 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 
609 aa  236  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7362  AMP-dependent synthetase and ligase  29.16 
 
 
624 aa  235  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.942718  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 
608 aa  234  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 
606 aa  233  9e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 
601 aa  231  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  27.93 
 
 
597 aa  231  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 
594 aa  230  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 
590 aa  230  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.18 
 
 
599 aa  230  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  28.41 
 
 
602 aa  229  8e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  28.12 
 
 
630 aa  229  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 
612 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 
609 aa  229  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  28.72 
 
 
606 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 
599 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 
610 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  26.72 
 
 
599 aa  228  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  28 
 
 
603 aa  228  3e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 
632 aa  227  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 
603 aa  226  8e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0623  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 
647 aa  226  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431706  normal  0.0874065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  28.34 
 
 
598 aa  226  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  29.22 
 
 
607 aa  226  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.94 
 
 
610 aa  226  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 
608 aa  226  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0692269  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6820  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 
653 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  29.57 
 
 
606 aa  225  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 
601 aa  225  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  27.33 
 
 
599 aa  224  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  30.34 
 
 
610 aa  224  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.95 
 
 
612 aa  224  3e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  29.89 
 
 
649 aa  223  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  28.03 
 
 
612 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  29.09 
 
 
602 aa  221  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  29.05 
 
 
600 aa  220  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  28.8 
 
 
615 aa  220  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.21 
 
 
612 aa  220  7e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  27.57 
 
 
600 aa  220  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  27.11 
 
 
622 aa  220  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2941  AMP-dependent synthetase and ligase  28.9 
 
 
773 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227779  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 
607 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 
602 aa  219  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 
599 aa  219  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 
606 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  26.16 
 
 
649 aa  217  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1274  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 
609 aa  218  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000455356 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  27.89 
 
 
620 aa  217  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 
613 aa  217  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>