More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29387 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009374  OSTLU_29387  Putative mitochondrial ribosomal protein S18  100 
 
 		 76 aa  152  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.222874 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0164  30S ribosomal protein S18  56.14 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000186991  normal  0.608438 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0829  ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0331  30S ribosomal protein S18  54.72 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000798674  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0313  30S ribosomal protein S18  52.83 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000570063  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1776  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000252079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26570  30S ribosomal protein S18  43.75 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.265078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3698  ribosomal protein S18  48.33 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  52 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37790  SSU ribosomal protein S18P  50.91 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.122065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4337  30S ribosomal protein S18  48.33 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3353  ribosomal protein S18  49.09 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1479  ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  60.1  0.000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31760  30S ribosomal protein S18  46.67 
 
 		 78 aa  60.1  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  46.67 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2523  30S ribosomal protein S18  54 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.799503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  46.67 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  51.72 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  51.72 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  51.72 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  51.72 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0129  30S ribosomal protein S18  54 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0292915 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  52.73 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  52.73 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  52.73 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  52.73 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3814  30S ribosomal protein S18  54.9 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295923  normal  0.120309 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  52.73 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0084  30S ribosomal protein S18  56.86 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.448199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  52.73 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  45 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0167  ribosomal protein S18  50 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000272348  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4179  30S ribosomal protein S18  49.09 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3488  30S ribosomal protein S18  54.9 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.329035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2463  30S ribosomal protein S18  54.9 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2986  30S ribosomal protein S18  54.9 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  47.27 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0310  ribosomal protein S18  52 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0899357 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  48.08 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  46.67 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  54 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  45 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2304  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.554922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1692  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  54 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  48.08 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  56 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0899  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0242171 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2295  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0262135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0600  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000175941  unclonable  0.00000679911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1511  30S ribosomal protein S18  55.1 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1113  ribosomal protein S18  48.98 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321408  normal  0.83859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4636  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2356  30S ribosomal protein S18  50.98 
 
 		 79 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160998  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3889  30S ribosomal protein S18  45.16 
 
 		 79 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0224203 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3039  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.230428 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2591  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4118  30S ribosomal protein S18  45.16 
 
 		 79 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5420  30S ribosomal protein S18  53.06 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0173473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0413  30S ribosomal protein S18  55.1 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420055  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1415  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  47.06 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  43.33 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  45.28 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0596  30S ribosomal protein S18  44.23 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  51.02 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3941  30S ribosomal protein S18  51.02 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3093  30S ribosomal protein S18  48 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0103903  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4416  30S ribosomal protein S18  51.02 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4309  30S ribosomal protein S18  51.02 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685461 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  47.27 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  51.02 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  48 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1211  SSU ribosomal protein S18P  51.02 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114712  normal  0.854081 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2779  30S ribosomal protein S18  49.02 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000612799  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2187  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1044  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4964  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0890  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0740  30S ribosomal protein S18  50.98 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1196  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215666  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1053  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.271077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3903  30S ribosomal protein S18  49.02 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000287817  normal  0.152503 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0113  30S ribosomal protein S18  49.02 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1917  30S ribosomal protein S18  51.02 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160715  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1519  30S ribosomal protein S18  51.02 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114713  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  48 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  52.08 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0928  30S ribosomal protein S18  39.34 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0375041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>