More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3903 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3903  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 88 aa  170  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000287817  normal  0.152503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0600  30S ribosomal protein S18  88.64 
 
 		 88 aa  140  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000175941  unclonable  0.00000679911 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1459  30S ribosomal protein S18  67.69 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4964  30S ribosomal protein S18  64.71 
 
 		 86 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  65.67 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  62.32 
 
 		 78 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  63.77 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  63.77 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  63.77 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  63.77 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  63.77 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  63.77 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  63.77 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  63.77 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  63.77 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  63.77 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  63.77 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  62.69 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0113  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 80 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 80 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  53.16 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  59.68 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0164  30S ribosomal protein S18  54.12 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000186991  normal  0.608438 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2008  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.922346  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  62.96 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0398  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0596  30S ribosomal protein S18  66 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 83 aa  72  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  72 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  50.7 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  64 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1776  30S ribosomal protein S18  54.88 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000252079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  50.7 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  56.94 
 
 		 81 aa  70.1  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  49.23 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 74 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0643  30S ribosomal protein S18  53.52 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  48.48 
 
 		 74 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  64.81 
 
 		 71 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  48.68 
 
 		 74 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08951  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519961  decreased coverage  0.000000161977 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  64.81 
 
 		 71 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  51.61 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 74 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  62.26 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  53.85 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10131  30S ribosomal protein S18  68.63 
 
 		 73 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.249582  hitchhiker  0.00103726 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2289  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1402  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2250  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.231321  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  48.48 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0340  30S ribosomal protein S18  68.63 
 
 		 73 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.042391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2414  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398519  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0829  ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1893  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2181  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  48.48 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0449  30S ribosomal protein S18  47.89 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000993889  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1166  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329961  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6207  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 71 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1402  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.494221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  68 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1872  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0004  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0418254  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09911  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5172  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09931  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0932  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0943286  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09501  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1895  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00156223  hitchhiker  0.0000000574659 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  64.71 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1321  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  53.23 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1781  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.708911  normal  0.881884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1809  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356271  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2445  ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2823  ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.408333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  61.22 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  62 
 
 		 76 aa  67  0.00000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1691  ribosomal protein S18  46.88 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 92 aa  67  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  49.25 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5173  30S ribosomal protein S18  64.71 
 
 		 71 aa  67  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3433  30S ribosomal protein S18  49.25 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00939921  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  48.48 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>