More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0331 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0331  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 75 aa  149  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000798674  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0313  30S ribosomal protein S18  92 
 
 		 75 aa  124  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000570063  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  70.42 
 
 		 76 aa  114  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  75.71 
 
 		 75 aa  111  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0560  30S ribosomal protein S18  59.46 
 
 		 76 aa  99  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.152801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  65 
 
 		 76 aa  88.6  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  56.92 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  58.06 
 
 		 76 aa  84.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  52.78 
 
 		 86 aa  83.6  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 78 aa  83.6  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 78 aa  83.6  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  60.61 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  53.25 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0953  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  53.25 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  53.52 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  54.1 
 
 		 76 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  51.61 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  55.93 
 
 		 76 aa  80.1  0.000000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  50.7 
 
 		 78 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0861  ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 88 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  52.78 
 
 		 74 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  51.61 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 70 aa  78.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  57.63 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  56.67 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3093  30S ribosomal protein S18  56.67 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0103903  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1215  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.30025  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0651  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1090  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1095  30S ribosomal protein S18  54.79 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.0284482 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  55.93 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  54.1 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  51.67 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  54.24 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  50 
 
 		 74 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  48.53 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  55.74 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  54.1 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  54.1 
 
 		 74 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  52.54 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  49.3 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 83 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0243  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.783981  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  48.61 
 
 		 83 aa  75.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  51.67 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  51.32 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  50 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  51.61 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0124  30S ribosomal protein S18  56.45 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0135  30S ribosomal protein S18  56.45 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0121  30S ribosomal protein S18  54.84 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.184225  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  54.1 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0117  30S ribosomal protein S18  56.45 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  54.1 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4738  ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  49.23 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  48.61 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1996  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.578713  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1691  ribosomal protein S18  49.25 
 
 		 79 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1998  ribosomal protein S18  50 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.471934  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1587  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  49.18 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1829  30S ribosomal protein S18  54.84 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1662  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>