More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0164 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0164  30S ribosomal protein S18  100 
 
 
91 aa  181  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000186991  normal  0.608438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1776  30S ribosomal protein S18  55.91 
 
 
92 aa  104  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000252079  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0829  ribosomal protein S18  62.35 
 
 
97 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18073  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  63.77 
 
 
75 aa  87.4  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4118  30S ribosomal protein S18  52.05 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3889  30S ribosomal protein S18  52.05 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0224203 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  44.71 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 
79 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
78 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 
75 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  51.43 
 
 
75 aa  75.9  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26570  30S ribosomal protein S18  50 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.265078 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  53.23 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23240  30S ribosomal protein S18  50.68 
 
 
79 aa  75.5  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  43.53 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  50 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  53.97 
 
 
90 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  58.33 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 
71 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  56.45 
 
 
78 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  54.84 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 
80 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4337  30S ribosomal protein S18  52.46 
 
 
78 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31760  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 
78 aa  72  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  42.22 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  48.72 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  55.93 
 
 
76 aa  72  0.000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1086  30S ribosomal protein S18  49.25 
 
 
73 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000857615  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29387  Putative mitochondrial ribosomal protein S18  56.14 
 
 
76 aa  71.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.222874 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0928  30S ribosomal protein S18  49.25 
 
 
73 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0375041  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  46.38 
 
 
74 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  52.31 
 
 
77 aa  71.6  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2523  30S ribosomal protein S18  47.3 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.799503  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  50 
 
 
74 aa  71.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  47.3 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3698  ribosomal protein S18  50.82 
 
 
78 aa  71.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  46.51 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  47.3 
 
 
78 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  49.33 
 
 
81 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  50.7 
 
 
76 aa  71.6  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  50 
 
 
78 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  47.44 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  47.89 
 
 
80 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  47.89 
 
 
80 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3353  ribosomal protein S18  50.82 
 
 
78 aa  71.2  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4179  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 
78 aa  71.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4964  30S ribosomal protein S18  48.84 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 
80 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  51.61 
 
 
76 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  44.58 
 
 
84 aa  70.9  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 
80 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2511  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37790  SSU ribosomal protein S18P  50.82 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.122065  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3903  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 
88 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000287817  normal  0.152503 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  45.21 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3039  30S ribosomal protein S18  48.24 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.230428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  47.95 
 
 
78 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  47.83 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  50 
 
 
76 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  50 
 
 
75 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0129  30S ribosomal protein S18  46.58 
 
 
79 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0292915 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  50 
 
 
81 aa  68.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  47.83 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  50.82 
 
 
76 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0780  ribosomal protein S18  40.91 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1351  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0404596  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  48 
 
 
78 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1773  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0140  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  47.83 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1511  30S ribosomal protein S18  52 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  53.23 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  47.83 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  42.53 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3745  30S ribosomal protein S18  56.14 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00458678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  53.57 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0890  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4738  ribosomal protein S18  41.98 
 
 
85 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  48.53 
 
 
76 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0876  30S ribosomal protein S18  40.91 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  52.46 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0600  30S ribosomal protein S18  61.11 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000175941  unclonable  0.00000679911 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  48.53 
 
 
76 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  50.82 
 
 
74 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  46.38 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>