More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5066 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 93 aa  157  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 79 aa  156  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0129  30S ribosomal protein S18  89.87 
 
 		 79 aa  144  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0292915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  77.22 
 
 		 78 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2523  30S ribosomal protein S18  77.22 
 
 		 78 aa  119  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.799503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4179  30S ribosomal protein S18  75.95 
 
 		 78 aa  115  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  74.68 
 
 		 78 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  73.42 
 
 		 78 aa  114  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  72.15 
 
 		 78 aa  114  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31760  30S ribosomal protein S18  73.42 
 
 		 78 aa  114  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3889  30S ribosomal protein S18  74.68 
 
 		 79 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0224203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4118  30S ribosomal protein S18  74.68 
 
 		 79 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23240  30S ribosomal protein S18  75.95 
 
 		 79 aa  112  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  73.33 
 
 		 78 aa  112  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26570  30S ribosomal protein S18  71.95 
 
 		 81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.265078 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37790  SSU ribosomal protein S18P  80 
 
 		 78 aa  110  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.122065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3698  ribosomal protein S18  80 
 
 		 78 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  72.15 
 
 		 78 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3353  ribosomal protein S18  78.46 
 
 		 78 aa  107  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0604  ribosomal protein S18  69.44 
 
 		 77 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4337  30S ribosomal protein S18  76.92 
 
 		 78 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  80.33 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 78 aa  101  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3093  30S ribosomal protein S18  75.41 
 
 		 78 aa  101  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0103903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  71.21 
 
 		 78 aa  100  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0310  ribosomal protein S18  79.31 
 
 		 82 aa  98.2  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0899357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4738  ribosomal protein S18  61.18 
 
 		 85 aa  97.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7041  30S ribosomal protein S18  83.64 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  77.19 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1217  30S ribosomal protein S18  72.41 
 
 		 82 aa  95.1  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.86687  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39410  SSU ribosomal protein S18P  81.82 
 
 		 82 aa  93.6  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5367  ribosomal protein S18  71.21 
 
 		 78 aa  93.6  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  61.64 
 
 		 81 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  56 
 
 		 86 aa  92  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2341  ribosomal protein S18  70.83 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.159544 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  55.56 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5492  30S ribosomal protein S18  67.19 
 
 		 83 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.115937  normal  0.0428851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1465  ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 84 aa  87.8  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159175  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  56.34 
 
 		 86 aa  87.4  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10054  30S ribosomal protein S18  74.55 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000781394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1309  ribosomal protein S18  72.22 
 
 		 63 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4167  ribosomal protein S18  69.09 
 
 		 85 aa  84.3  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5368  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5744  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.241708 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5457  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18106  normal  0.0124957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0876  30S ribosomal protein S18  70.91 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6032  30S ribosomal protein S18  54.02 
 
 		 87 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 80 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5912  ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12092  30S ribosomal protein S18  63.75 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000379639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  58.06 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0643  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  57.38 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  55 
 
 		 65 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  61.4 
 
 		 78 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  51.43 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 76 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 76 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2187  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0890  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1095  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.0284482 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0043  ribosomal protein S18  50 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1044  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143453 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  54.84 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  62.75 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5173  30S ribosomal protein S18  66 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  54.84 
 
 		 88 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  62.75 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 77 aa  72  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14781  30S ribosomal protein S18  58.46 
 
 		 73 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1351  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0404596  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0140  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1773  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0164  30S ribosomal protein S18  47.3 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000186991  normal  0.608438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>