More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12092 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12092  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 88 aa  178  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000379639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5492  30S ribosomal protein S18  70.89 
 
 		 83 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.115937  normal  0.0428851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1309  ribosomal protein S18  77.42 
 
 		 63 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26570  30S ribosomal protein S18  66.2 
 
 		 81 aa  99.4  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.265078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0604  ribosomal protein S18  75.38 
 
 		 77 aa  98.2  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0129  30S ribosomal protein S18  64.1 
 
 		 79 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0292915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 93 aa  96.7  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  63.75 
 
 		 79 aa  96.7  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2523  30S ribosomal protein S18  62.82 
 
 		 78 aa  96.7  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.799503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3353  ribosomal protein S18  69.23 
 
 		 78 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4337  30S ribosomal protein S18  68.18 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31760  30S ribosomal protein S18  65.22 
 
 		 78 aa  94.4  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3698  ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4179  30S ribosomal protein S18  63.77 
 
 		 78 aa  93.6  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37790  SSU ribosomal protein S18P  67.69 
 
 		 78 aa  93.6  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.122065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1465  ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 84 aa  92  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159175  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23240  30S ribosomal protein S18  63.77 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3889  30S ribosomal protein S18  65.22 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0224203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4118  30S ribosomal protein S18  65.22 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 78 aa  87  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1217  30S ribosomal protein S18  68.97 
 
 		 82 aa  86.7  9e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.86687  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2341  ribosomal protein S18  51.76 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.159544 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0310  ribosomal protein S18  65.52 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0899357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  64.38 
 
 		 78 aa  84  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  67.8 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3093  30S ribosomal protein S18  70.91 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0103903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  68.97 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  56.41 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5744  30S ribosomal protein S18  54.93 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.241708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5368  30S ribosomal protein S18  54.93 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5457  30S ribosomal protein S18  54.93 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18106  normal  0.0124957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 78 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10054  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 84 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000781394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4738  ribosomal protein S18  67.27 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  67.24 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  67.92 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7041  30S ribosomal protein S18  67.27 
 
 		 79 aa  76.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  65.45 
 
 		 78 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  52.56 
 
 		 78 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  67.27 
 
 		 78 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5367  ribosomal protein S18  61.02 
 
 		 78 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39410  SSU ribosomal protein S18P  63.16 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  67.92 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4167  ribosomal protein S18  63.64 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6032  30S ribosomal protein S18  59.65 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0876  30S ribosomal protein S18  61.82 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  59.26 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5912  ribosomal protein S18  58.49 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  56.6 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  60.38 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  49.33 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3294  ribosomal protein S18  60.78 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0164  30S ribosomal protein S18  49.3 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000186991  normal  0.608438 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0043  ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  53.57 
 
 		 71 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  48.61 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_002620  TC0185  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.390146  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  53.45 
 
 		 80 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  48 
 
 		 79 aa  66.6  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  48 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  58 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  51.79 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  51.72 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  51.72 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  51.79 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5173  30S ribosomal protein S18  59.62 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  48.39 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  56.6 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1123  30S ribosomal protein S18  55.36 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.561974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  48.48 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  48.48 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  52.63 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  52.63 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  52.63 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  52.63 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08951  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519961  decreased coverage  0.000000161977 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  51.85 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0643  30S ribosomal protein S18  50.85 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2250  30S ribosomal protein S18  52.54 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.231321  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2779  30S ribosomal protein S18  53.7 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000612799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1402  30S ribosomal protein S18  52.54 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1321  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2414  30S ribosomal protein S18  52.54 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  51.79 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2181  30S ribosomal protein S18  52.54 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0004  30S ribosomal protein S18  52.54 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0418254  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  54.72 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  54.72 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  50 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1166  30S ribosomal protein S18  52.54 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329961  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6207  30S ribosomal protein S18  52.54 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1895  30S ribosomal protein S18  52.54 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00156223  hitchhiker  0.0000000574659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1872  30S ribosomal protein S18  52.54 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>