More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3294 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3294  ribosomal protein S18  100 
 
 		 79 aa  156  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1465  ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159175  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1217  30S ribosomal protein S18  60.34 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.86687  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0310  ribosomal protein S18  63.46 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0899357 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4179  30S ribosomal protein S18  62.26 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2523  30S ribosomal protein S18  50.68 
 
 		 78 aa  72  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.799503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1309  ribosomal protein S18  66 
 
 		 63 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0604  ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4337  30S ribosomal protein S18  58.49 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37790  SSU ribosomal protein S18P  59.62 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.122065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26570  30S ribosomal protein S18  59.62 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.265078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3353  ribosomal protein S18  58.49 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3698  ribosomal protein S18  59.62 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23240  30S ribosomal protein S18  60.78 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  52.46 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10054  30S ribosomal protein S18  56.36 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000781394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4167  ribosomal protein S18  59.62 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2341  ribosomal protein S18  59.62 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.159544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5492  30S ribosomal protein S18  62 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.115937  normal  0.0428851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31760  30S ribosomal protein S18  57.69 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0876  30S ribosomal protein S18  46.67 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4118  30S ribosomal protein S18  56.86 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3889  30S ribosomal protein S18  56.86 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0224203 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3093  30S ribosomal protein S18  59.62 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0103903  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  46.58 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7041  30S ribosomal protein S18  57.69 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6032  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5744  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.241708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4738  ribosomal protein S18  47.37 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5368  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0129  30S ribosomal protein S18  44.74 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0292915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5457  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18106  normal  0.0124957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  62 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5367  ribosomal protein S18  57.69 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39410  SSU ribosomal protein S18P  53.85 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  54.72 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  55.77 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  56 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  52 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  49.12 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12092  30S ribosomal protein S18  60.78 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000379639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5173  30S ribosomal protein S18  51.85 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1123  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.561974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  50.98 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  54 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  54 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  54 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  54 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  54 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  54 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  48 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  50 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  54 
 
 		 78 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08951  30S ribosomal protein S18  49.09 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519961  decreased coverage  0.000000161977 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  54 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  54 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  48.08 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  54 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5912  ribosomal protein S18  50 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  54 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  54 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09911  30S ribosomal protein S18  48.21 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0932  30S ribosomal protein S18  48.21 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0943286  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09501  30S ribosomal protein S18  48.21 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  43.1 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09931  30S ribosomal protein S18  48.21 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1321  30S ribosomal protein S18  48.15 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1479  ribosomal protein S18  48 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  48.08 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  49.02 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0043  ribosomal protein S18  52.83 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0596  30S ribosomal protein S18  51.92 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  48 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  50.98 
 
 		 80 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  47.37 
 
 		 71 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3039  30S ribosomal protein S18  54 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.230428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  47.37 
 
 		 71 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3096  30S ribosomal protein S18  43.86 
 
 		 71 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  49.02 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0398  30S ribosomal protein S18  48.08 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  40.58 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0167  ribosomal protein S18  46 
 
 		 74 aa  52  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000272348  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3729  30S ribosomal protein S18  42.11 
 
 		 72 aa  52  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0084  30S ribosomal protein S18  45.28 
 
 		 74 aa  52  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.448199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  49.02 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0340  30S ribosomal protein S18  45.45 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.042391  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0140  30S ribosomal protein S18  46.3 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1137  30S ribosomal protein S18  46.43 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0842555  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  48 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>