More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1479 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1479  ribosomal protein S18  100 
 
 		 77 aa  150  4e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0167  ribosomal protein S18  89.66 
 
 		 74 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000272348  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 74 aa  77  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002334  SSU ribosomal protein S18p  61.11 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.134261  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00021  30S ribosomal protein S18  61.11 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 77 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2779  30S ribosomal protein S18  59.26 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000612799  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0572  ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.504032  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2764  30S ribosomal protein S18  61.11 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  56.34 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  51.43 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  57.41 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  63.16 
 
 		 78 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5729  30S ribosomal protein S18  51.43 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.237828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 75 aa  73.6  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  46.48 
 
 		 75 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04069  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3791  ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00509801  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4446  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4763  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0776  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000892175  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4753  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0729519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4671  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00669693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3811  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5717  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.375297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4672  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4789  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0373  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4735  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260572  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  66 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4811  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0274683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0164  30S ribosomal protein S18  53.25 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000186991  normal  0.608438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4661  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0796  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000510602  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04031  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  58.62 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2004  30S ribosomal protein S18  53.45 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  58.62 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3667  30S ribosomal protein S18  46.48 
 
 		 91 aa  72  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0312817  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1977  30S ribosomal protein S18  53.45 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.402888  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3433  30S ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00939921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3349  30S ribosomal protein S18  47.14 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000024458  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 76 aa  72  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0829  ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  47.89 
 
 		 76 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31760  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  47.89 
 
 		 76 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  48.48 
 
 		 74 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  56.9 
 
 		 80 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03777  30S ribosomal protein S18  53.45 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3782  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3637  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0682  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0448  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2385  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  49.3 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4179  30S ribosomal protein S18  51.39 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1058  30S ribosomal protein S18  59.26 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 76 aa  71.2  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1415  30S ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3464  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1549  30S ribosomal protein S18  48.48 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1434  30S ribosomal protein S18  48.48 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1218  SSU ribosomal protein S18P  52.24 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1949  30S ribosomal protein S18  46.38 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.879875  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3745  30S ribosomal protein S18  53.45 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00458678  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0084  30S ribosomal protein S18  52.11 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.448199  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0417  ribosomal protein S18  53.57 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225211  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0643  30S ribosomal protein S18  48.72 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>