More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0643 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0643  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 79 aa  158  2e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 		 80 aa  92  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 		 80 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 		 80 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  57.75 
 
 		 77 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  56.34 
 
 		 78 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  56.34 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  56.34 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  56.34 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  56.34 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 75 aa  84.3  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  54.93 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  54.93 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  54.93 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  54.93 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  54.93 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  54.93 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1949  30S ribosomal protein S18  52.11 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.879875  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  52.86 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  60.87 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0493  30S ribosomal protein S18  48.75 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1402  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27665  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1893  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910904  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2414  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398519  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5172  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1166  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329961  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2181  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1895  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00156223  hitchhiker  0.0000000574659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1402  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.494221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6207  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2250  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.231321  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0004  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0418254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2289  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1872  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  56.52 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 74 aa  80.1  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1519  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 82 aa  80.1  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114713  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2454  30S ribosomal protein S18  49.25 
 
 		 91 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427357  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1781  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.708911  normal  0.881884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1809  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356271  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0913  30S ribosomal protein S18  49.25 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.317596 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  47.76 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0740  30S ribosomal protein S18  48.75 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  59.68 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  56.92 
 
 		 77 aa  78.2  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  56.92 
 
 		 78 aa  77.8  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1549  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1434  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 78 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2511  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  60.34 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  50 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  49.23 
 
 		 74 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1788  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685938  normal  0.111131 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1196  30S ribosomal protein S18  47.5 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215666  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1053  30S ribosomal protein S18  47.5 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.271077 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  49.23 
 
 		 74 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0454  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0234797  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31760  30S ribosomal protein S18  55.22 
 
 		 78 aa  76.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  44.78 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1917  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160715  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  49.25 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0568  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0460  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0129  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0292915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0084  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.448199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  41.1 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2004  30S ribosomal protein S18  47.69 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5729  30S ribosomal protein S18  49.23 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.237828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  47.06 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_002620  TC0185  30S ribosomal protein S18  47.5 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.390146  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1309  30S ribosomal protein S18  46.27 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1218  SSU ribosomal protein S18P  50.77 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  47.83 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  42.47 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1977  30S ribosomal protein S18  47.69 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.402888  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  47.69 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1044  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143453 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  47.69 
 
 		 74 aa  74.7  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1184  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0394823  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3667  30S ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0312817  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1511  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0413  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 78 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420055  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1245  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0202382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2588  30S ribosomal protein S18  44.62 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3119  30S ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.258718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0596  30S ribosomal protein S18  54.39 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>