More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0185 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0185  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 81 aa  167  4e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.390146  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 		 80 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 80 aa  86.7  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 80 aa  86.7  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  56.52 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3349  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 75 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000024458  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1053  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.271077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1196  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215666  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0740  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2008  30S ribosomal protein S18  48.75 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.922346  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_004310  BR0454  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0234797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1519  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0460  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 74 aa  80.1  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5420  30S ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 83 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0173473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0568  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 82 aa  80.1  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1917  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 82 aa  80.1  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0084  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 74 aa  80.1  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.448199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  62.12 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0398  30S ribosomal protein S18  45.68 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  59.32 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1415  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04069  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3791  ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00509801  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4753  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0729519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3811  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4789  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4735  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260572  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4671  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00669693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4661  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0776  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000892175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4672  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4446  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0373  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4811  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0274683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5717  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.375297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0796  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000510602  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04031  hypothetical protein  52.17 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4763  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4309  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685461 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  52.86 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0413  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 78 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420055  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3941  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182221 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  67.92 
 
 		 65 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4416  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0493  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1901  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 74 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0899  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0242171 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3433  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00939921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2304  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.554922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2356  30S ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160998  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 92 aa  76.6  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1949  30S ribosomal protein S18  50.65 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.879875  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3039  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.230428 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3362  ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0596  30S ribosomal protein S18  62.07 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2591  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 83 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1549  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1434  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1692  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4636  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1113  ribosomal protein S18  49.37 
 
 		 83 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321408  normal  0.83859 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 80 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 80 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2588  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>