More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2592 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 83 aa  169  9e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1113  ribosomal protein S18  78.31 
 
 		 83 aa  133  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321408  normal  0.83859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2008  30S ribosomal protein S18  75.9 
 
 		 83 aa  130  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.922346  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0398  30S ribosomal protein S18  69.88 
 
 		 83 aa  125  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  81.94 
 
 		 87 aa  125  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  84.06 
 
 		 98 aa  117  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  75.34 
 
 		 92 aa  115  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09983  ribosomal protein S18  79.1 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.596989  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  71.01 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_002950  PG0596  30S ribosomal protein S18  77.78 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  62.69 
 
 		 78 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  60 
 
 		 74 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 77 aa  87  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 		 80 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 78 aa  84.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  52.05 
 
 		 74 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  56.92 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 80 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 80 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 65 aa  82  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  53.52 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  49.3 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  56.34 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1949  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.879875  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  49.3 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  50.7 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  47.95 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 79 aa  80.1  0.000000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0004  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0418254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1402  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1895  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00156223  hitchhiker  0.0000000574659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1402  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.494221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2414  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398519  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1893  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5172  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2181  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  50.7 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2250  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.231321  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6207  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1781  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.708911  normal  0.881884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1809  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356271  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1872  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582114  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2289  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1166  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329961  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  61.4 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  49.3 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0913  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.317596 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  62.5 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  61.4 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2393  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2454  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427357  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3349  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000024458  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1549  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1434  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5729  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.237828  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2823  ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.408333  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2445  ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042166 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  61.4 
 
 		 77 aa  78.2  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3433  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00939921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2588  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3035  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000854539  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1309  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3214  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  49.3 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2567  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3791  ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00509801  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4672  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4446  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4763  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4753  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0729519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4811  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0274683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1133  30S ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>