More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_915 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  100 
 
 		 147 aa  294  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  95.92 
 
 		 147 aa  283  5e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  93.88 
 
 		 147 aa  278  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0780  ribosomal protein S18  61.84 
 
 		 116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  68.75 
 
 		 76 aa  100  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  65.67 
 
 		 94 aa  99.4  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4964  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  59.72 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  59.21 
 
 		 80 aa  97.1  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  59.21 
 
 		 80 aa  97.1  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 97 aa  93.6  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  60 
 
 		 86 aa  92.4  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  60.94 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  60 
 
 		 87 aa  91.7  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 78 aa  92  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  55.7 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 78 aa  90.5  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 84 aa  90.5  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 76 aa  90.5  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  63.08 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  47.56 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  57.53 
 
 		 74 aa  88.6  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 77 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  52 
 
 		 86 aa  89  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  56.94 
 
 		 75 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  51.69 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  60.56 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 75 aa  88.6  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 81 aa  88.2  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 78 aa  88.2  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  51.69 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  56.06 
 
 		 74 aa  87.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  55.22 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  49.38 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 80 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 76 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 77 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 78 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 77 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 77 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  56.16 
 
 		 75 aa  85.9  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 74 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 77 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  51.39 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 78 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  51.39 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 76 aa  84.3  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 81 aa  84.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  51.19 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 78 aa  84.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 77 aa  84  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04069  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3791  ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00509801  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4763  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3811  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0796  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000510602  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4735  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260572  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4753  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0729519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4671  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00669693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0776  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000892175  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5717  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.375297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04031  hypothetical protein  55.56 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0373  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4661  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4811  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0274683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4672  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4446  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4789  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4738  ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 85 aa  83.6  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>