More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0012 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  100 
 
 
106 aa  216  7e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  69.44 
 
 
79 aa  110  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  67.11 
 
 
81 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  67.12 
 
 
79 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  71.21 
 
 
78 aa  107  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  69.7 
 
 
77 aa  107  5e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  60 
 
 
78 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  65.62 
 
 
80 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  64.06 
 
 
80 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  58.11 
 
 
77 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  64.06 
 
 
80 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  65.08 
 
 
76 aa  90.5  7e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  58.11 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  58.11 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  58.11 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  66.13 
 
 
75 aa  89.4  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  58.11 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  58.11 
 
 
77 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  58.11 
 
 
77 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  58.11 
 
 
77 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  58.11 
 
 
77 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  58.11 
 
 
77 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  62.5 
 
 
78 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  58.11 
 
 
77 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  46.51 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  41.23 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  69.64 
 
 
65 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
76 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  63.33 
 
 
76 aa  82  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
76 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0164  30S ribosomal protein S18  49.38 
 
 
91 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000186991  normal  0.608438 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0340  30S ribosomal protein S18  67.92 
 
 
73 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.042391  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10131  30S ribosomal protein S18  67.92 
 
 
73 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.249582  hitchhiker  0.00103726 
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  45.05 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  65.52 
 
 
87 aa  80.5  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  52.94 
 
 
74 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0643  30S ribosomal protein S18  58.46 
 
 
79 aa  80.5  0.000000000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  51.25 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  43.4 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  60.71 
 
 
92 aa  79.7  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  49.25 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  45.45 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14781  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 
73 aa  78.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  43.96 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  64.29 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  43.96 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  52.17 
 
 
76 aa  78.2  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0932  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 
73 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0943286  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09911  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 
73 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  47.37 
 
 
92 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09501  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 
73 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  53.42 
 
 
75 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09931  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 
73 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  43.93 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0331  30S ribosomal protein S18  57.63 
 
 
75 aa  77.8  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000798674  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  58.93 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 
75 aa  78.2  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0596  30S ribosomal protein S18  62.5 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0113  30S ribosomal protein S18  68 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0313  30S ribosomal protein S18  57.63 
 
 
75 aa  77  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000570063  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1123  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 
71 aa  77  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.561974  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 
78 aa  76.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 
78 aa  76.6  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0398  30S ribosomal protein S18  50.65 
 
 
83 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1113  ribosomal protein S18  51.47 
 
 
83 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321408  normal  0.83859 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  50 
 
 
81 aa  76.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  50 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  64.71 
 
 
71 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  53.73 
 
 
93 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  64.71 
 
 
71 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 
71 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  53.73 
 
 
79 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1137  30S ribosomal protein S18  62.26 
 
 
73 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1337  30S ribosomal protein S18  62.26 
 
 
73 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2008  30S ribosomal protein S18  60.71 
 
 
83 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.922346  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5173  30S ribosomal protein S18  64.71 
 
 
71 aa  75.5  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 
78 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  48.44 
 
 
87 aa  75.1  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0140  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 
75 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3096  30S ribosomal protein S18  62.75 
 
 
71 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  46.27 
 
 
78 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 
75 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1351  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 
75 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0404596  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  56.14 
 
 
83 aa  74.7  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1773  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 
75 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  50.75 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  50.77 
 
 
75 aa  74.3  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  46.97 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  47.78 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3729  30S ribosomal protein S18  60.38 
 
 
72 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  53.03 
 
 
90 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08951  30S ribosomal protein S18  60.38 
 
 
73 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519961  decreased coverage  0.000000161977 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1776  30S ribosomal protein S18  48.75 
 
 
92 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000252079  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1621  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 
75 aa  74.3  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0249871  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2187  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 
75 aa  73.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  46.58 
 
 
80 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  47.06 
 
 
74 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>