More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1549 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1549  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 75 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1434  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 75 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  72.97 
 
 		 74 aa  120  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  70.27 
 
 		 74 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04069  30S ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3791  ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00509801  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5717  30S ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.375297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4811  30S ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0274683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4671  30S ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00669693  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0796  30S ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000510602  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0373  30S ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3811  30S ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4735  30S ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0776  30S ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000892175  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4446  30S ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4753  30S ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0729519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4661  30S ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04031  hypothetical protein  71.62 
 
 		 75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4672  30S ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4763  30S ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4789  30S ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  70.67 
 
 		 75 aa  117  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  117  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3433  30S ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  117  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00939921  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  70.67 
 
 		 75 aa  116  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  70.67 
 
 		 75 aa  116  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  70.67 
 
 		 75 aa  116  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  70.67 
 
 		 75 aa  116  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  70.67 
 
 		 75 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  70.67 
 
 		 75 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  70.67 
 
 		 75 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  70.67 
 
 		 75 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  70.27 
 
 		 74 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  70.67 
 
 		 75 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  70.67 
 
 		 75 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  70.67 
 
 		 75 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  70.67 
 
 		 75 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3349  30S ribosomal protein S18  71.62 
 
 		 75 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000024458  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  70.67 
 
 		 75 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  70.27 
 
 		 75 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  69.33 
 
 		 75 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  69.33 
 
 		 75 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0682  30S ribosomal protein S18  70.27 
 
 		 75 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0448  30S ribosomal protein S18  70.27 
 
 		 75 aa  114  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435788 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3782  30S ribosomal protein S18  70.27 
 
 		 75 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3637  30S ribosomal protein S18  70.27 
 
 		 75 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0572  ribosomal protein S18  70.27 
 
 		 75 aa  113  6.9999999999999995e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.504032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2588  30S ribosomal protein S18  63.51 
 
 		 76 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752864 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00745  30S ribosomal protein S18  62.16 
 
 		 76 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613411  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  64 
 
 		 76 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  64 
 
 		 76 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  62.67 
 
 		 75 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2132  30S ribosomal protein S18  60.81 
 
 		 76 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157171  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2051  30S ribosomal protein S18  60.81 
 
 		 76 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.255921  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  62.16 
 
 		 76 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  65.33 
 
 		 75 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  62.16 
 
 		 74 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 75 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1086  30S ribosomal protein S18  61.97 
 
 		 73 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000857615  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1949  30S ribosomal protein S18  61.43 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.879875  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0928  30S ribosomal protein S18  61.97 
 
 		 73 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0375041  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03777  30S ribosomal protein S18  72.58 
 
 		 75 aa  100  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2393  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3464  30S ribosomal protein S18  73.77 
 
 		 76 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3035  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000854539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3745  30S ribosomal protein S18  69.35 
 
 		 75 aa  98.6  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00458678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0221  ribosomal protein S18  68.85 
 
 		 74 aa  98.2  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07650  30S ribosomal protein S18  72.13 
 
 		 76 aa  97.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46947  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5661  30S ribosomal protein S18  70.49 
 
 		 76 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65170  30S ribosomal protein S18  70.49 
 
 		 76 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0983  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 93 aa  97.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.878884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1820  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 93 aa  97.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179313  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2779  30S ribosomal protein S18  69.35 
 
 		 75 aa  97.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000612799  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0913  30S ribosomal protein S18  59.15 
 
 		 91 aa  97.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.317596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2567  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 93 aa  97.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3214  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 93 aa  97.4  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2828  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 94 aa  97.1  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0889  SSU ribosomal protein S18P  70.97 
 
 		 75 aa  97.1  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3667  30S ribosomal protein S18  56.34 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0312817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2385  30S ribosomal protein S18  72.13 
 
 		 76 aa  97.1  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1528  30S ribosomal protein S18  56.76 
 
 		 96 aa  97.1  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0286405  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2195  30S ribosomal protein S18  57.75 
 
 		 94 aa  96.7  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00559271  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4876  30S ribosomal protein S18  70.49 
 
 		 76 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00021  30S ribosomal protein S18  67.74 
 
 		 75 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1781  30S ribosomal protein S18  59.15 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.708911  normal  0.881884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0646  30S ribosomal protein S18  72.13 
 
 		 76 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.934429  hitchhiker  0.000938781 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002334  SSU ribosomal protein S18p  67.74 
 
 		 75 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.134261  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1058  30S ribosomal protein S18  70.49 
 
 		 75 aa  96.7  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4933  30S ribosomal protein S18  70.49 
 
 		 76 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000854262 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4667  30S ribosomal protein S18  70.49 
 
 		 76 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0382262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4757  30S ribosomal protein S18  70.49 
 
 		 76 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697439 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1809  30S ribosomal protein S18  59.15 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356271  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1893  30S ribosomal protein S18  59.15 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910904  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2289  30S ribosomal protein S18  59.15 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1309  30S ribosomal protein S18  56.34 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2764  30S ribosomal protein S18  68.85 
 
 		 75 aa  95.9  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1166  30S ribosomal protein S18  59.15 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329961  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2181  30S ribosomal protein S18  59.15 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5227  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 93 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1872  30S ribosomal protein S18  59.15 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>