More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0009 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 78 aa  156  8e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  83.54 
 
 		 81 aa  133  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  79.75 
 
 		 79 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  78.48 
 
 		 79 aa  130  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  92.42 
 
 		 77 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  89.39 
 
 		 94 aa  125  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  75.68 
 
 		 77 aa  110  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  73.33 
 
 		 78 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  75.68 
 
 		 77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  75.68 
 
 		 77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  75.68 
 
 		 77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  75.68 
 
 		 77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  72.31 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  74.32 
 
 		 77 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  74.32 
 
 		 77 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  74.32 
 
 		 77 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  74.32 
 
 		 77 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  74.32 
 
 		 77 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  74.32 
 
 		 77 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  73.13 
 
 		 80 aa  100  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  71.64 
 
 		 80 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  71.64 
 
 		 80 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  64.06 
 
 		 75 aa  91.3  4e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  63.49 
 
 		 76 aa  88.6  3e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  53.75 
 
 		 80 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  53.75 
 
 		 80 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  63.24 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  63.33 
 
 		 74 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  56.96 
 
 		 89 aa  84.7  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  63.33 
 
 		 76 aa  85.5  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1321  30S ribosomal protein S18  71.7 
 
 		 71 aa  84.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5173  30S ribosomal protein S18  71.7 
 
 		 71 aa  84  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 81 aa  84  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  66.07 
 
 		 65 aa  83.6  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 71 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 71 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1123  30S ribosomal protein S18  68.52 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.561974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  62.5 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3119  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.258718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  62.5 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  60 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  65.52 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  56.67 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1137  30S ribosomal protein S18  67.86 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1337  30S ribosomal protein S18  67.86 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  51.95 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  51.95 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  52.86 
 
 		 74 aa  80.5  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09501  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 73 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09931  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 73 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0932  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 73 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0943286  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09911  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 73 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  49.25 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0493  30S ribosomal protein S18  54.79 
 
 		 82 aa  80.1  0.000000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 76 aa  80.1  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3488  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 79 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.329035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3096  30S ribosomal protein S18  64.81 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0140  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0113  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2356  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4964  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0643  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1773  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1351  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0404596  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0340  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 73 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.042391  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1692  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1621  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0249871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  52.86 
 
 		 76 aa  79.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10131  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 73 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.249582  hitchhiker  0.00103726 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  51.9 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  61.4 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0568  30S ribosomal protein S18  54.79 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14781  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_004310  BR0454  30S ribosomal protein S18  54.79 
 
 		 82 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0234797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1196  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215666  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0460  30S ribosomal protein S18  54.79 
 
 		 82 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  60.71 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1053  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.271077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2463  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2986  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2187  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08951  30S ribosomal protein S18  62.5 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519961  decreased coverage  0.000000161977 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0890  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2511  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1044  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1917  30S ribosomal protein S18  54.79 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2008  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 83 aa  77.8  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.922346  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1519  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114713  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0185  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.390146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  54.84 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>