More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0021 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  100 
 
 		 90 aa  187  5e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  76.54 
 
 		 86 aa  140  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  77.78 
 
 		 87 aa  140  7e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  75.31 
 
 		 86 aa  138  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  67.65 
 
 		 78 aa  107  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  66.18 
 
 		 78 aa  107  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  63.24 
 
 		 78 aa  106  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  64.71 
 
 		 78 aa  106  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  64.71 
 
 		 78 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  65.67 
 
 		 78 aa  103  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  70.49 
 
 		 78 aa  100  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  67.21 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3093  30S ribosomal protein S18  68.85 
 
 		 78 aa  98.6  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0103903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7041  30S ribosomal protein S18  69.35 
 
 		 79 aa  98.2  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  68.85 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5367  ribosomal protein S18  70.49 
 
 		 78 aa  97.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4738  ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 85 aa  98.2  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  68.85 
 
 		 78 aa  96.7  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39410  SSU ribosomal protein S18P  67.69 
 
 		 82 aa  95.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4167  ribosomal protein S18  56.52 
 
 		 85 aa  94.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0043  ribosomal protein S18  52.56 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10054  30S ribosomal protein S18  64.06 
 
 		 84 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000781394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  61.19 
 
 		 81 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  52.11 
 
 		 84 aa  90.5  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0876  30S ribosomal protein S18  63.49 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5368  30S ribosomal protein S18  63.33 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5744  30S ribosomal protein S18  63.33 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.241708 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5457  30S ribosomal protein S18  63.33 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18106  normal  0.0124957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6032  30S ribosomal protein S18  63.49 
 
 		 87 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 147 aa  87.4  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  59.68 
 
 		 76 aa  87.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 93 aa  87.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 80 aa  87  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 80 aa  87  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  54.29 
 
 		 74 aa  86.7  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 147 aa  86.7  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  86.3  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 79 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0129  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 79 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0292915 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  52.63 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  61.29 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5912  ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4179  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  48.72 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  50.68 
 
 		 106 aa  83.6  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 76 aa  83.6  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 96 aa  83.6  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0780  ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  55.74 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0861  ribosomal protein S18  50 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2523  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.799503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  57.38 
 
 		 74 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  55.74 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  49.38 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1691  ribosomal protein S18  44.87 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  60.66 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 76 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 74 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 76 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0953  30S ribosomal protein S18  51.43 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  55 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  55.74 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  55.74 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0604  ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  52.05 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  52.05 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37790  SSU ribosomal protein S18P  67.92 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.122065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  52.05 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0121  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.184225  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  58.46 
 
 		 74 aa  80.5  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2029  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0313  30S ribosomal protein S18  55.17 
 
 		 75 aa  80.1  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000570063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>