More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2341 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2341  ribosomal protein S18  100 
 
 		 85 aa  174  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.159544 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26570  30S ribosomal protein S18  67.14 
 
 		 81 aa  92.8  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.265078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0129  30S ribosomal protein S18  70.42 
 
 		 79 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0292915 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  70.83 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  73.91 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2523  30S ribosomal protein S18  66.2 
 
 		 78 aa  90.1  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.799503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4179  30S ribosomal protein S18  62.67 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3353  ribosomal protein S18  67.19 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37790  SSU ribosomal protein S18P  67.19 
 
 		 78 aa  87  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.122065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3698  ribosomal protein S18  68.25 
 
 		 78 aa  86.7  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4337  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 78 aa  87  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5492  30S ribosomal protein S18  58.9 
 
 		 83 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.115937  normal  0.0428851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31760  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 78 aa  85.1  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3889  30S ribosomal protein S18  68.85 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0224203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4118  30S ribosomal protein S18  68.85 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  58.9 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0604  ribosomal protein S18  69.09 
 
 		 77 aa  83.6  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0310  ribosomal protein S18  73.58 
 
 		 82 aa  83.6  9e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0899357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  60.87 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  59.15 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3093  30S ribosomal protein S18  69.64 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0103903  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0876  30S ribosomal protein S18  53.66 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23240  30S ribosomal protein S18  68.85 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1217  30S ribosomal protein S18  69.81 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.86687  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6032  30S ribosomal protein S18  53.66 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  67.27 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  71.7 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  55.71 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1309  ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 63 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  69.81 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5457  30S ribosomal protein S18  54.88 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18106  normal  0.0124957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5744  30S ribosomal protein S18  54.88 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.241708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5368  30S ribosomal protein S18  54.88 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  65.45 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7041  30S ribosomal protein S18  68.52 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10054  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000781394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  71.15 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4167  ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 85 aa  76.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5367  ribosomal protein S18  71.15 
 
 		 78 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1465  ribosomal protein S18  54.79 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4738  ribosomal protein S18  64.81 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  50.75 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39410  SSU ribosomal protein S18P  69.23 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12092  30S ribosomal protein S18  51.76 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000379639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  50.75 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  50.68 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  50 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1123  30S ribosomal protein S18  60.34 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.561974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  51.67 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5912  ribosomal protein S18  58.49 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  60.38 
 
 		 80 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  52.63 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  58.49 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  55.17 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  58.49 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  58.49 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  50.68 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3294  ribosomal protein S18  59.62 
 
 		 79 aa  67.4  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  56.9 
 
 		 71 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  56.9 
 
 		 71 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0043  ribosomal protein S18  58.49 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  55.36 
 
 		 77 aa  67  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  58.49 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  56.6 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 74 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0331  30S ribosomal protein S18  52.83 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000798674  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  56.6 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  56.6 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1137  30S ribosomal protein S18  56.9 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1337  30S ribosomal protein S18  56.9 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3096  30S ribosomal protein S18  62 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0313  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000570063  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0340  30S ribosomal protein S18  55.17 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.042391  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09911  30S ribosomal protein S18  55.17 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0932  30S ribosomal protein S18  55.17 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0943286  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10131  30S ribosomal protein S18  55.17 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.249582  hitchhiker  0.00103726 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08951  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519961  decreased coverage  0.000000161977 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  57.41 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  51.85 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09931  30S ribosomal protein S18  55.17 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  52.54 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09501  30S ribosomal protein S18  55.17 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  53.57 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  53.57 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1773  30S ribosomal protein S18  62 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0140  30S ribosomal protein S18  62 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1351  30S ribosomal protein S18  62 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0404596  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  56.6 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1321  30S ribosomal protein S18  53.45 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  56.6 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  56.6 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>