More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0043 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0043  ribosomal protein S18  100 
 
 		 135 aa  274  3e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  66.67 
 
 		 81 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  70.31 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  64.79 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  68.75 
 
 		 78 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  73.33 
 
 		 78 aa  100  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  65.62 
 
 		 78 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  71.67 
 
 		 78 aa  99.4  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3093  30S ribosomal protein S18  71.67 
 
 		 78 aa  98.2  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0103903  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  71.67 
 
 		 78 aa  97.1  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  68.75 
 
 		 78 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4167  ribosomal protein S18  58.44 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  49.4 
 
 		 87 aa  95.1  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  52.56 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  53.57 
 
 		 86 aa  93.6  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  68.75 
 
 		 78 aa  93.6  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5744  30S ribosomal protein S18  61.64 
 
 		 84 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.241708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5368  30S ribosomal protein S18  61.64 
 
 		 84 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5457  30S ribosomal protein S18  61.64 
 
 		 84 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18106  normal  0.0124957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6032  30S ribosomal protein S18  57.47 
 
 		 87 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10054  30S ribosomal protein S18  61.64 
 
 		 84 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000781394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5367  ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 78 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  48.72 
 
 		 86 aa  90.5  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 84 aa  90.1  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  63.33 
 
 		 78 aa  90.1  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0876  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5912  ribosomal protein S18  60 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4738  ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 85 aa  87.8  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  64.18 
 
 		 75 aa  87  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7041  30S ribosomal protein S18  63.93 
 
 		 79 aa  87  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39410  SSU ribosomal protein S18P  59.38 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0780  ribosomal protein S18  50 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  54.84 
 
 		 88 aa  80.1  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 77 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  47.3 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  48.65 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 76 aa  79.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  49.28 
 
 		 74 aa  77.4  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  50.63 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  57.38 
 
 		 76 aa  76.6  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  50.63 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  47.17 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 70 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  49.25 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  51.9 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1662  30S ribosomal protein S18  50.7 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 80 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0398  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  56.67 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0129  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 79 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0292915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  51.61 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  55.74 
 
 		 78 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2523  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 78 aa  73.9  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.799503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0861  ribosomal protein S18  47.89 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  46.27 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  46.27 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26570  30S ribosomal protein S18  55.22 
 
 		 81 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.265078 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  58.93 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  48.68 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4179  30S ribosomal protein S18  51.43 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0560  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 76 aa  72  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.152801  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4337  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  41.89 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3889  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0224203 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31760  30S ribosomal protein S18  52.86 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4118  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3353  ribosomal protein S18  62.26 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0643  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37790  SSU ribosomal protein S18P  62.26 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.122065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0121  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.184225  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  58.18 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3698  ribosomal protein S18  62.26 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  42.42 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23240  30S ribosomal protein S18  62.26 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0117  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  56.36 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  56.67 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 91 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  49.18 
 
 		 76 aa  70.1  0.000000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf694  ribosomal protein S18  37.84 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>