More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0876 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0876  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 88 aa  180  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6032  30S ribosomal protein S18  97.73 
 
 		 87 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5744  30S ribosomal protein S18  88.64 
 
 		 84 aa  153  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.241708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5368  30S ribosomal protein S18  88.64 
 
 		 84 aa  153  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5457  30S ribosomal protein S18  88.64 
 
 		 84 aa  153  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18106  normal  0.0124957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10054  30S ribosomal protein S18  87.5 
 
 		 84 aa  151  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000781394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4738  ribosomal protein S18  65.91 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4167  ribosomal protein S18  71.25 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7041  30S ribosomal protein S18  73.13 
 
 		 79 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39410  SSU ribosomal protein S18P  72.46 
 
 		 82 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  70.42 
 
 		 78 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  71.64 
 
 		 78 aa  104  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  64.94 
 
 		 78 aa  104  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  65.82 
 
 		 78 aa  103  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5367  ribosomal protein S18  74.63 
 
 		 78 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  63.29 
 
 		 78 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3093  30S ribosomal protein S18  71.64 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0103903  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  64.56 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  62.03 
 
 		 78 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  68.66 
 
 		 78 aa  100  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  68.66 
 
 		 78 aa  98.2  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  68.66 
 
 		 78 aa  97.8  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  63.49 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26570  30S ribosomal protein S18  66.22 
 
 		 81 aa  90.5  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.265078 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  65.08 
 
 		 86 aa  89.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4179  30S ribosomal protein S18  72.58 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3353  ribosomal protein S18  70.97 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2523  30S ribosomal protein S18  70.97 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.799503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4337  30S ribosomal protein S18  69.35 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  65.08 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3698  ribosomal protein S18  70.97 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0043  ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 135 aa  88.6  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  60.32 
 
 		 86 aa  87.8  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37790  SSU ribosomal protein S18P  69.35 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.122065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31760  30S ribosomal protein S18  70.18 
 
 		 78 aa  85.1  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3889  30S ribosomal protein S18  73.21 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0224203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4118  30S ribosomal protein S18  73.21 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23240  30S ribosomal protein S18  72.73 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  70.91 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2341  ribosomal protein S18  53.66 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.159544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0129  30S ribosomal protein S18  70.91 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0292915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  53.85 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  70.91 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  50.65 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  50.65 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0310  ribosomal protein S18  65.45 
 
 		 82 aa  79.7  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0899357 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1217  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 		 82 aa  79.7  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.86687  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  51.43 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  51.43 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  50.65 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  50.65 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0604  ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  54.84 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  40.96 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  44.87 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 77 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1309  ribosomal protein S18  68 
 
 		 63 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 74 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  53.23 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  56.45 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 80 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 80 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1465  ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 84 aa  73.6  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5492  30S ribosomal protein S18  66 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.115937  normal  0.0428851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  50 
 
 		 81 aa  72  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  49.21 
 
 		 74 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  51.61 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5912  ribosomal protein S18  53.23 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1998  ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.471934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  55.93 
 
 		 71 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  55.93 
 
 		 71 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  45.45 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1123  30S ribosomal protein S18  62 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.561974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  47.69 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  49.23 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0121  30S ribosomal protein S18  46.03 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.184225  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>