More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5066 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  100 
 
 		 78 aa  161  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  91.03 
 
 		 78 aa  147  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  87.18 
 
 		 78 aa  142  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  85.9 
 
 		 78 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  83.33 
 
 		 78 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  82.05 
 
 		 78 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  83.33 
 
 		 78 aa  138  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  83.33 
 
 		 78 aa  124  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  83.33 
 
 		 78 aa  122  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3093  30S ribosomal protein S18  87.18 
 
 		 78 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0103903  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  83.33 
 
 		 78 aa  122  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5367  ribosomal protein S18  84.62 
 
 		 78 aa  120  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7041  30S ribosomal protein S18  89.87 
 
 		 79 aa  120  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4738  ribosomal protein S18  74.03 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4167  ribosomal protein S18  75.36 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  74.68 
 
 		 79 aa  114  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  76.71 
 
 		 93 aa  114  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39410  SSU ribosomal protein S18P  79.71 
 
 		 82 aa  110  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0129  30S ribosomal protein S18  72.15 
 
 		 79 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0292915 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  64.79 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4179  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 		 78 aa  107  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  63.77 
 
 		 87 aa  107  8.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  64.71 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  61.11 
 
 		 86 aa  104  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10054  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000781394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2523  30S ribosomal protein S18  67.95 
 
 		 78 aa  103  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.799503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5744  30S ribosomal protein S18  60.71 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.241708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5368  30S ribosomal protein S18  60.71 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5457  30S ribosomal protein S18  60.71 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18106  normal  0.0124957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0876  30S ribosomal protein S18  63.29 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26570  30S ribosomal protein S18  65.43 
 
 		 81 aa  99  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.265078 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  63.77 
 
 		 81 aa  98.6  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6032  30S ribosomal protein S18  63.29 
 
 		 87 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31760  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 78 aa  97.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23240  30S ribosomal protein S18  62.82 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0043  ribosomal protein S18  59.15 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3889  30S ribosomal protein S18  60.26 
 
 		 79 aa  94.4  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0224203 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  61.43 
 
 		 97 aa  94.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4118  30S ribosomal protein S18  60.26 
 
 		 79 aa  94.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  61.43 
 
 		 96 aa  94.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0604  ribosomal protein S18  58.11 
 
 		 77 aa  92.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37790  SSU ribosomal protein S18P  76.36 
 
 		 78 aa  92  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.122065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3353  ribosomal protein S18  76.36 
 
 		 78 aa  91.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3698  ribosomal protein S18  76.36 
 
 		 78 aa  91.3  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4337  30S ribosomal protein S18  71.19 
 
 		 78 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 77 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  49.37 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0310  ribosomal protein S18  67.8 
 
 		 82 aa  87.8  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0899357 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0135  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0124  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  56.52 
 
 		 80 aa  87.4  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  56.52 
 
 		 80 aa  87.4  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0121  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.184225  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 75 aa  86.7  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  55.22 
 
 		 92 aa  85.9  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1217  30S ribosomal protein S18  64.41 
 
 		 82 aa  86.7  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.86687  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  52.94 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  55.22 
 
 		 92 aa  85.9  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0117  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  55.22 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  60.66 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1095  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.0284482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5912  ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 75 aa  84.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 94 aa  83.6  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 80 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 80 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2029  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  56.45 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1411  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 87 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000532082  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2341  ribosomal protein S18  57.53 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.159544 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  53.23 
 
 		 74 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  47.95 
 
 		 76 aa  80.9  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 76 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0780  ribosomal protein S18  49.25 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0560  30S ribosomal protein S18  45.83 
 
 		 76 aa  79.7  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.152801  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1465  ribosomal protein S18  54.79 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1998  ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.471934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1351  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2023  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.344457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  55.93 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>